Patohistološki laboratorij obavlja djelatnost obrade tkivnih uzoraka od fiksacije do izrade histoloških preparata te pokriva potrebe stručne djelatnosti kao i potrebe znanstveno istraživačkih projekata Zavoda za patologiju i drugih Zavoda i Katedri Medicinskog fakulteta te suradnih ustanova.
Djelatnost se odvija kroz nekoliko faza i u nekoliko laboratorija, od zaprimanja bioptičkih uzoraka, pripreme parafinskih rezova do histokemijskog bojenja koje osigurava prepoznavanje raznih struktura stanica i tkiva.
Standardiziran rad laboratorija osigurava kvalificirani kadar medicinsko – laboratorijskih inženjera i tehničara uz primjenu uređaja za automatsko procesiranje, uklapanje i bojenje tkiva.