Istraživačke grupe

Zavod za medicinsku biologiju i genetiku

Istraživačka grupa: (Epi)genetika humane reprodukcije

prof. dr. sc. Saša Ostojić, dr. med.

Članovi grupe: izv. prof. Nina Pereza, doc. dr. sc. Sanja Dević Pavlić, dr. sc. Anita Barišić, Tea Mladenić, mag. bioteh. in med., prof. dr. sc. Borut Peterlin, prof. dr. sc. Alena Buretić-Tomljanović

Zavod za medicinsku biologiju i genetiku ima višedesetljetnu tradiciju u znanstveno-istraživačkom području humane reprodukcije s jakim temeljem u reprodukcijskoj imunologiji. U posljednjih dvadeset godina naglasak je prvenstveno usmjeren na istraživanje područja (epi)genetike ponavljajućih spontanih pobačaja, prijevremenih poroda i neplodnosti čovjeka. Znanstvena su istraživanja snažno određena kolaborativnim projektima s relevantnim institucijama, poput KBC Rijeka i Kliničkog instituta za genomsku medicinu u Ljubljani. Iz brojnih istraživačkih projekata proizašlo je više doktorskih i magistarskih radova uz znanstveno-stručne publikacije u najrelevantnijim časopisima područja. Budućnost vizije razvoja znanstveno-istraživačke skupine usmjerena je na genomski pristup ponavljajućim spontanim pobačajima i prijevremenim porodima u žena, kao i što snažnijoj implementaciji u medicinskoj praksi kroz suradnju s kliničkom bazom i realnim pacijentima.

Publikacije:

1. Pereza N, Ostojić S, Kapović M, Peterlin B. Systematic review and meta-analysis of genetic association studies in idiopathic recurrent spontaneous abortion. Fertil Steril. 2017 Jan;107:150-9.
2. Lovrečić L, Pereza N, Jaklič H, Ostojić S, Peterlin B. Combination of QF-PCR and aCGH is an efficient diagnostic strategy for the detection of chromosome aberrations in recurrent miscarriage. Mol Genet Genomic Med. 2019;7:e980.
3. Pereza N, Črnjar K, Buretić-Tomljanović A, Volk M, Kapović M, Peterlin B, Ostojić S. Y chromosome azoospermia factor region microdeletions are not associated with idiopathic recurrent spontaneous abortion in a Slovenian population: association study and literature review. Fertil Steril. 2013;99:1663-7.
4. Barišić A, Stanković A, Stojković L, Pereza N, Ostojić S, Peterlin A, Peterlin B, Vraneković J. Maternal LINE-1 DNA Methylation in Early Spontaneous Preterm Birth. Biol Res Nurs. 2022;24:85-93.
5. Barišić A, Pereza N, Hodžić A, Ostojić S, Peterlin B. A Single Nucleotide Polymorphism of DNA methyltransferase 3B gene is a risk factor for recurrent spontaneous abortion. Am J Reprod Immunol. 2017;78.

Centar za proteomiku

Istraživačka grupa „Biologija i patogeneza virusnih infekcija“

izv. prof. Berislav Lisnić, dipl. ing.

Članovi grupe: dr. sc. Vanda Juranić Lisnić, izv. prof., dr. sc. Jelena Tomac, red. prof., dr. sc. Marija Mazor, dr. sc. Jelena Železnjak, dr. sc. Darija Kveštak, doc. dr. sc. Đurđica Cekinović, dr. sc. Mijo Golemac, Tina Ružić, mag. biotech. in med., Gian Pietro Pietri, ind. pharm. chem. 

Istraživačka grupa za biologiju i patogenezu virusnih infekcija se bavi razjašnjavanjem funkcije citomegalovirusnih gena tijekom infekcije domaćina, istraživanjem biologije i patogeneze citomegalovirusne infekcije u nadbubrežnim žlijezdama i mikrogliji, kao i sudjelovanjem u razvoju inovativnih farmaceutskih proizvoda s protuvirusnim djelovanjem u suradnji s tvrtkom Jadran-galenski laboratorij. Uz znanstvena istraživanja, pojedini članovi grupe su za potrebe Kliničkog bolničkog centra Rijeka aktivno sudjelovali u provedbi laboratorijske dijagnostike bolesti COVID-19. Aktivnost grupe financirana je projektima Hrvatske zaklade za znanost, Europskog fonda za regionalni razvoj i Sveučilišta u Rijeci.

Publikacije:

1. Ruzic, T., V. J. Lisnic, H. M. Lucin, T. L. Rovis, J. Zeleznjak, M. C. Brdovcak, A. Vrbanovic, D. Oreb, D. Kvestak, K. G. Jercic, F. Borovecki, P. Lucin, B. Adler, S. Jonjic and B. Lisnic (2022). “Characterization of M116.1p, a Murine Cytomegalovirus Protein Required for Efficient Infection of Mononuclear Phagocytes.” Journal of Virology 96(2). 
2. Tomac, J.*, M. Mazor*, B. Lisnic*, M. Golemac, D. Kvestak, M. Bralic, L. B. Zulle, M. M. Brinkmann, L. Dolken, L. S. Reinert, S. R. Paludan, A. Krmpotic, S. Jonjic and V. J. Lisnic (2021). “Viral infection of the ovaries compromises pregnancy and reveals innate immune mechanisms protecting fertility.” Immunity 54(7): 1478-+. 
3. Lisnic, B., J. Tomac, D. Cekinovic, S. Jonjic and V. J. Lisnic (2021). “Rodent Models of Congenital Cytomegalovirus Infection.” Human Cytomegaloviruses, 2 Edition 2244: 365-401. 
4. Redwood, A. J., L. L. Masters, B. C. Chan, S. Leary, C. Forbes, S. Jonjic, V. J. Lisnic, B. Lisnic^# and L. M. Smith^# (2020). “Repair of an Attenuated Low-Passage Murine Cytomegalovirus Bacterial Artificial Chromosome Identifies a Novel Spliced Gene Essential for Salivary Gland Tropism.” Journal of Virology 94(22). 
5. Lisnic, B., V. J. Lisnic and S. Jonjic (2015). “NK cell interplay with cytomegaloviruses.” Current Opinion in Virology 15: 9-18. 

Zavod za temeljnu i kliničku farmakologiju s toksikologijom

Istraživačka grupa: CarNanoTBI

Izv. prof. dr. sc. Kristina Pilipović, dr. med.

Članovi grupe: Nika Gržeta, mag. bioteh. in med.,Dr. sc. Anja Harej Hrkać, mag. bioteh. in med.,Tamara Janković, dipl. sanit. ing., Doc. dr. sc. Petra Dolenec, dipl. ing. biol., prof. biol., Dr. sc. Jelena Rajič Bumber, dipl. inž. biol.

Istraživački tim voditeljice izv. prof. dr. sc. Kristina Pilipović osnovan je u sklopu uspostavnog istraživačkog projekta Hrvatske zaklade za znanost “Jednozidne ugljikove nanocjevčice u eksperimentalnoj traumatskoj ozljedi mozga” (CarNanoTBI). Astrociti, najbrojnije i najraznolikije stanice središnjeg živčevlja, snažni su regulatori homeostaze staničnog okoliša, a brojni dokazi upućuju na značajnu ulogu reaktivne astrocitoze u sinaptičkoj plastičnosti i reorganizaciji neuralnih krugova nakon traumatske ozljede mozga (engl. traumatic brain injury, TBI). Obećavajući pristup koji bi mogao omogućiti oporavak oštećenog mozga nakon TBI je tkivni inženjering koji je usmjeren na premoštenje strukturalnih defekata u moždanom tkivu. Ugljikove nanocjevčice (engl. carbon nanotubes, CNTs) imaju brojne izuzetne osobitosti (veličina, čvrstoća, fleksibilnost, vodljivost i biokompatibilnost) koje ih čine obećavajućim materijalom za brojne biomedicinske aplikacije. Hipoteze ovog projekta jesu kako kemijski funkcionalizirane jednozidne CNTs potiču preživljenje i proliferaciju te utječu na funkcije astrocita podvrgnutih in vitro TBI, a kako nakon intracerebralne aplikacije u miša s TBI potpomažu oporavak i regeneraciju.

Odabrane publikacije:

1. Janković T, Dolenec P, Rajič Bumber J, Gržeta N, Križ J, Župan G, Pilipović K. Differential expression patterns of TDP-43 in single moderate versus repetitive mild traumatic brain injury in mice. Int J Mol Sci 2021;22(22):12211. (Q1; IF 5,924)
2. Pilipović K, Rajič Bumber J, Dolenec P, Gržeta N, Janković T, Križ J, Župan G. Long-term effects of repetitive mild traumatic injury on the visual system in wild-type and TDP-43 transgenic mice. Int J Mol Sci 2021;22(12):6584. (Q1; IF 5,924)
3. Rajič Bumber J, Pilipović K, Janković T, Dolenec P, Gržeta N, Križ J, Župan G. Repetitive traumatic brain injury is associated with TDP-43 alterations, neurodegeneration, and glial activation in mice. J Neuropathol Exp Neurol 2021;80:2–14. (Q1; IF 3,685)
4. Dolenec P, Pilipović K, Rajič J, Župan G. Temporal pattern of neurodegeneration, programmed cell death, and neuroplastic responses in the thalamus after lateral fluid percussion brain injury in the rat. J Neuropathol Exp Neurol 2015;74:512-26. (Q1; IF 3,685)

Zavod za histologiju i embriologiju

Istraživačka grupa: CD8 T-cell biology
Immune-endocrine interactions

Izv. prof. dr. sc. Felix M. Wensveen

Članovi grupe: Dr. sc. Inga Kavazović, Mia Krapić, MSc; Dora Gašparini, dr. med.; Doc. dr. sc. Tamara Turk Wensveen.

Being sick makes us miserable. For example, appetite is decreased, we get a temperature and lose muscle strength. Whereas we experience this as pathology, in fact it is a carefully orchestrated, physiological response mediated by the immune system with the purpose to minimize pathogen replication, whilst maximizing immune cell activity. How this is mediated is largely unknown. The research of my team focuses on three major topics: 1. How is CD8 T cell biology regulated on a fundamental level? 2. How does the immune system impact endocrine regulation of systemic metabolism? 3. How does endocrine regulation of systemic metabolism impact the immune system. We study these topics in mice using advanced genetic models to study the immune system and dietary models to induce metabolic disease. In addition, we collaborate with the team of Doc. Turk Wensveen to collect samples of people with diabetes, to study these processes in human cells.

Selected publications:

1. Kavazović I, Krapić M,Beumer-Chuwonpad A, Polić B, Turk Wensveen T, Lemmermann NA, Van Gisbergen KPJM, Wensveen FM, Hyperglycemia and not hyperinsulinemia mediates diabetes-induced memory cd8 t cell dysfunction, Diabetes. 2022 Jan 14:db210209. (Impact factor 9.5).
2. Kavazović I, Han H, Balzaretti G, Slinger E, Lemmermann NAW, Ten Brinke A, Merkler D, Koster J, Bryceson Y, De Vries N, Jonjić S, Klarenbeek PL, Polić B, Eldering E, Wensveen FM, Eomes broadens the scope of CD8 T cell memory by inhibiting apoptosis in cells of low affinity. PLoS Biol. 2020 Mar 17;18(3):e3000648. (Impact factor 8.0).
3. Turk Wensveen T, Fučkar Ćupić D, Jurišić Eržen D, Polić B, Wensveen FM, Severe lipoatrophy in a patient with diabetes mellitus type 2 in response to glargine and degludec insulin: Possible involvement of CD4 T cell mediated tissue remodelling. Diabetes Care. 2020 Feb;43(2):494-496. doi: 10.2337/dc19-1888. (Impact factor 19.1).
4. Šestan M, Marinović S, Kavazović I, Cekinović Đ, Wueest S, Turk Wensveen T, Brizić I, Jonjić S, Konrad D, Wensveen FM^*, Polić B*. Virus-Induced Interferon-γ Causes Insulin Resistance in Skeletal Muscle and Derails Glycemic Control in Obesity. Immunity. 2018 Jul 17;49(1):164-177.e6. doi: 10.1016/j.immuni.2018.05.005. (Impact factor 31.7).
5. Kavazović I, Lenartić M, Jelenčić V, Jurković S, Lemmermann NAW, Jonjić S, Polić B, Wensveen FM, NKG2D stimulation of CD8+ T cells during priming promotes their capacity to produce cytokines in response to viral infection in mice. Eur J Immunol. 2017 Jul;47(7):1123-1135. doi: 10.1002/eji.201646805. (Impact factor 5.5).

*Shared senior authorship.

URL: https://sites.google.com/view/tcellmemory

URL (scopus): https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=12902681800

Katedra za društvene i humanističke znanosti u medicini

Istraživačka grupa: „Europska bioetika“

Istraživačka skupina Europska bioetika koju čine Toni Buterin, Robert Doričić, Igor Eterović, Amir Muzur (voditelj), Iva Rinčić i Ivana Tutić Grokša s Katedre za društvene i humanističke znanosti u medicini Fakulteta, temelji svoj rad na bogatoj tradiciji Katedrinog pionirskog uključenja u suvremene tijekove bioetike. U njenome su istraživačkom fokusu promocija europske intelektualne misli i njena valorizacija u problematiziranju suvremenih bioetičkih pitanja. Članovi skupine jezgra su uredništva međunarodnog znanstvenog časopisa Jahr – Europski časopis za bioetiku, a pokreću i niz projekata fokusiranih na europsku bioetiku koji su rezultirali s jednim projektom HERA-e, tri HRZZ-a, tri UNIRI-a, prvom međunarodnom konferencijom o Fritzu Jahru, „Riječkom deklaracijom o budućnosti bioetike“ te osnivanjem Dokumentacijsko‑istraživačkog centra za europsku bioetiku „Fritz Jahr“ kao jedne od institucija‑nositeljica mreže Znanstvenog centra izvrsnosti za integrativnu bioetiku. Članovi skupine su redovito aktivni i u organizaciji najdugovječnijeg kontinuiranog bioetičkog simpozija u zemlji – Riječkih dana bioetike.

Odabrane publikacije:

1. Rinčić I, Muzur A. 2019. Fritz Jahr and the Emergence of European Bioethics. Zürich: Lit. (translated from Croatian)
2. Muzur A, Rinčić I. 2019. Van Rensselaer Potter and His Place in the History of Bioethics. Zürich: Lit. (translated from Croatian)
3. Rinčić I, Muzur A. 2011. Fritz Jahr: the invention of bioethics and beyond. Perspectives in Biology and Medicine 54 (4), 550-556.
4. Muzur A, Rinčić I, Sodeke S. 2016. The real Wisconsin Idea: the seven pillars of Van Rensselaer Potter’s bioethics. Journal of Agricultural and Environmental Ethics 29 (4), 587-596.
5. Rinčić I, Buterin T, Doričić R, Eterović I, Gensabella M, Muzur A. 2021. The right to exit the footnote: a story of rediscovery and revival of Fritz Jahr’s bioethics (with special regard to Italy). Medicina e morale 1, 11-24.

Zavod za medicinsku fiziku i zaštitu od zračenja KBC Rijeka/Katedra za medicinsku fiziku i biofiziku MedRi

ISTRAŽIVAČKA GRUPA: Fizika ionizirajućeg zračenja i primjena u medicini

Izv.prof. dr. sc. Slaven Jurković 

Zavod za medicinsku fiziku i zaštitu od zračenja se bavi istraživanjima vezanim za fizikalne aspekte ionizirajućeg zračenja i njegovu primjenu u medicini. Istraživanja su eksperimentalna i za njihovu provedbu su nužni istraživači s temeljnom naobrazbom iz fizike te sofisticirana oprema. Grupa trenutno broji devet članova koji su, sukladno interesima i ekspertizom, udruženi u podgrupe. Oprema je u najvećoj mjeri nabavljena putem projekata financiranih od Međunarodne agencije za atomsku energiju (IAEA) koje Zavod vodi i provodi unatrag posljednjih 13 godina (sedam projekata). Vrlo dinamična istraživačka aktivnost Zavoda je, u posljednjih pet godina, rezultirala objavama dvadesetak znanstvenih članaka u međunarodnim časopisima iz područja medicinske fizike i prikazima tridesetak radova na konferencijama. Istraživački potencijal grupe je unatrag posljednjih pet godina povećan izradom dviju doktorskih disertacija u području istraživanja, a planirano je da to u skoroj u budućnosti bude dodatno učinjeno kroz obrane doktorskih disertacija doktoranada na Doktorskom studiju Fizika Odjela za fiziku Sveučilišta u Rijeci. 

Odabrane publikacije:

1. Božanić, Ana; Šegota, Doris; Dundara Debeljuh, Dea; Švabić Kolacio, Manda; Smilović Radojčić, Đeni; Ružić, Katarina; Budanec, Mirjana; Kasabašić, Mladen; Hrepić, Darijo; Valković Zujić, Petra; Brambilla, Marco; Kalra, Mannudeep; Jurković, Slaven. National Reference Levels of CT Procedures dedicated for Treatment Planning in Radiation Oncology, European Journal of Medical Physics, 96 (2022) 123–129, https://doi.org/10.1016/j.ejmp.2022.03.001 
2. Švabić Kolacio, Manda; Brkić, Hrvoje; Faj, Dario; Smilović Radojčić, Đeni; Rajlić, David; Obajdin; Nevena; Jurković, Slaven. Validation of two calculation options built in Elekta Monaco Monte Carlo based algorithm using MCNP code. Radiation physics and chemistry, 179(2021), 109237, 7 
3. Dundara Debeljuh, Dea; Jurković, Slaven; Pribanić, Ivan; Poljak, Frano; Kralik, Ivana; Krstonošić, Branislav; Bralić, Ante; Bajan, Tamara; Božac, Ondina; Vidošević, Ljiljana; Kumrić, Danijela; Zrilić, Ivana; Šegota, Doris; Diklić, Ana; Smilović Radojčić, Đeni; Vassileva Jenia. National survey to set diagnostic reference levels in nuclear medicine single photon emission imaging in Croatia, European Journal of Medical Physics, 78 (2020), 109-116 
4. Smilović Radojčić, Đeni; Casar, Božidar; Rajlić, David; Švabic Kolacio, Manda; Mendez, Ignasi; Obajdin, Nevena; Dundara Debeljuh, Dea; Jurković, Slaven. Experimental validation of Monte Carlo based treatment planning system in bone density equivalent media. Radiology and oncology, 54 (2020), 4; 495-504 doi:10.2478/raon2020-0051) 
5. Smilović Radojčić, Đeni; Rajlić, David; Casar, Božidar; Švabić Kolacio, Manda; Obajdin, Nevena; Faj, Dario; Jurković, Slaven. Evaluation of two-dimensional dose distributions for pre-treatment patient-specific IMRT dosimetry. Radiology and oncology, 52 (2018), 3; 346-352 doi:10.2478/raon-2018-0019 
6. Smilović Radojčić, Đeni; Švabić Kolacio, Manda; Radojčić, Milan; Rajlić, David; Casar, Božidar; Faj, Dario; Jurković, Slaven. Comparison of calculated dose distributions reported as dose-to-water and dose-to-medium for intensity-modulated radiotherapy of nasopharyngeal cancer patients. Medical dosimetry. (2017) https://doi.org/10.1016/j.meddos.2017.11.008

Katedre za socijalnu medicinu i epidemiologiju

Istraživačka grupa: Health for All?!

Prof. dr. sc. Tomislav Rukavina

Članovi grupe: Prof. dr. sc. Tomislav Rukavina, dr. med., Izv. prof. dr. sc. Vanja Vasiljev, mag. sanit. ing., Doc. dr. sc. Lovorka Bilajac, mag. sanit. ing., Denis Juraga, mag. sanit. ing., Mihaela Marinović Glavić, mag. sanit. ing.

Rad istraživačke grupe Katedre za socijalnu medicinu i epidemiologiju obuhvaća različite teme iz područja javnog zdravstva, uključujući istraživanja učinkovitosti intervencija u zajednici, promociju zdravlja te prevenciju bolesti s ciljem poboljšanja kvalitete života stanovnika. Trenutna istraživanja se provode u okviru znanstvenog projekta ValueCare (Obzor2020). Cilj projekta je razvoj učinkovitog modela integrirane zdravstvene i socijalne skrbi temeljenog na dokazima, primarno usmjeren na osobe starije životne dobi suočene s kroničnim nezaraznim bolestima. Vizija projekta je da se koncept zdravog starenja zasniva na pravu svake osobe starije dobi da živi što je moguće kvalitetniji život temeljen na vrijednostima koje se trebaju omogućiti kroz kvalitetnu, personaliziranu, dostupnu i integriranu skrb . Cilj istraživačke grupe je generiranje znanja o sprečavanju bolesti, otkrivanju uzročno posljedičnih veza u prevenciji kroničnih nezaraznih bolesti, personaliziranoj brizi o zdravlju uz korištenje istraživačke infrastrukture temeljene na suvremenoj informacijsko-komunikacijskoj tehnologiji u međunarodnom okruženju radi prijenosa i razmjene stečenog znanja te primjenu u populaciji.

Odabrane publikacije:

1. Ožić S, Vasiljev V, Ivković V, Bilajac L, Rukavina T. Interventions aimed at loneliness and fall prevention reduce frailty in elderly urban population. Medicine (Baltimore). 2020 Feb;99(8):e19145. doi: 10.1097/MD.0000000000019145. PMID: 32080091; PMCID: PMC7034624. – WoSCC Q2
2. Franse CB, Zhang X, van Grieken A, Rietjens J, Alhambra-Borrás T, Durá E, Garcés-Ferrer J, van Staveren R, Rentoumis T, Markaki A, Bilajac L, Vasiljev Marchesi V, Rukavina T, Verma A, Williams G, Clough G, Koppelaar E, Martijn R, Mattace Raso F, Voorham AJJ, Raat H. A coordinated preventive care approach for healthy ageing in five European cities: A mixed methods study of process evaluation components. J Adv Nurs. 2019 Dec;75(12):3689-3701. doi: 10.1111/jan.14181. Epub 2019 Oct 6. PMID: 31441529. – WoSCC Q1
3. Zhang X, Tan SS, Fierloos I, Zanutto O, Alhambra-Borrás T, Vasiljev V, Bennett S, Rentoumis T, Buranello A, Macchione S, Rouwet E, van Grieken A, Raat H. Evaluation design of the Social Engagement Framework for Addressing the Chronic-disease-challenge (SEFAC): a mindfulness-based intervention to promote the self-management of chronic conditions and a healthy lifestyle. BMC Public Health. 2019 May 30;19(1):664. doi: 10.1186/s12889-019-6979-7. PMID: 31146709; PMCID: PMC6543603. – Scopus Q1
4. Franse CB, van Grieken A, Alhambra-Borrás T, Valía-Cotanda E, van Staveren R, Rentoumis T, Markaki A, Bilajac L, Marchesi VV, Rukavina T, Verma A, Williams G, Koppelaar E, Martijn R, Voorham AJJ, Mattace Raso F, Garcés-Ferrer J, Raat H. The effectiveness of a coordinated preventive care approach for healthy ageing (UHCE) among older persons in five European cities: A pre-post controlled trial. Int J Nurs Stud. 2018 Dec;88:153-162. doi: 10.1016/j.ijnurstu.2018.09.006. Epub 2018 Sep 8. PMID: 30296635. – WoSCC Q1
5. Franse CB, Voorham AJJ, van Staveren R, Koppelaar E, Martijn R, Valía-Cotanda E, Alhambra-Borrás T, Rentoumis T, Bilajac L, Marchesi VV, Rukavina T, Verma A, Williams G, Clough G, Garcés-Ferrer J, Mattace Raso F, Raat H. Evaluation design of Urban Health Centres Europe (UHCE): preventive integrated health and social care for community-dwelling older persons in five European cities. BMC Geriatr. 2017 Sep 11;17(1):209. doi: 10.1186/s12877-017-0606-1. PMID: 28893178; PMCID: PMC5594491. – Scopus Q1

Centar za proteomiku

Istraživačka skupina: “Imunobiologija i patogeneza virusnih infekcija u ranom životu”

doc. dr. sc. Ilija Brizić

Članovi grupe: prof. dr. sc. Stipan Jonjić, dr. sc. Marina Pribanić Matešić, dr. sc. Carmen Rožmanić, mag. mol. bio., Fran Krstanović, mag. biochem. (doktorand), Andrea Mihalić, mag. biotech. in med. (doktorandica)

Istraživačka skupina ima u fokusu dva pravca istraživanja:

1. patogeneza prirođene citomegalovirusne infekcije u središnjem živčanom sustavu i
2. utjecaj infekcija u ranom životu na preoblikovanje prirođenih imunoloških stanica.

U okviru prvog pravca istražuje prirođenu infekciju citomegalovirusom koja je glavni uzročnik transplacentarno prenosivih prirođenih infekcija koja može uzrokovati široki spektar strukturnih i funkcionalnih oštećenja i trajne neurološke posljedice.

Glavni ciljevi ovih istraživanja su odrediti mehanizme nastanka oštećenja živčanog sustava i mehanizme imunološke kontrole tijekom akutne faze infekcije i latencije citomegalovirusa u živčanom sustavu.

U okviru drugog pravca istražuju kako prirođene limfoidne stanice NK i ILC1 pridonose kontroli infekcija u perinatalnom razdoblju te kako infekcija interferira s razvojem ovih stanica.

Istraživanja se provode u okviru tri projekta financirana od strane Hrvatske zaklade za znanost i Europskog socijalnog fonda, te potpora Sveučilišta u Rijeci.

Publikacije:

1. Rožmanić C, Lisnić B, Pribanić Matešić M, Mihalić A, Hiršl L, Park E, Lesac Brizić A, Indenbirken D, Viduka I, Šantić M, Adler B, Yokoyama WM, Krmpotić A, Juranić Lisnić V, Jonjić S, Brizić I. (2023) Perinatal murine cytomegalovirus infection reshapes the transcriptional profile and functionality of NK cells. Nat Commun. 19(12):e1011793.
2. Brlić PK, Pavletić M, Lerga M, Krstanović F, Matešić MP, Miklić K, Malić S, Mikša L, Pajcur M, Peruč D, Schubert M, Bertoglio F, Arapović J, Protić A, Šustić A, Milošević M, Šain LČ, Jonjić S, Lisnić VJ, Brizić I. (2023) SARS-CoV-2 Spike and Nucleocapsid Antibody Response in Vaccinated Croatian Healthcare Workers and Infected Hospitalized Patients: A Single Center Cohort Study. Viruses. 14(9):1966.
3. Brizić I, Lisnić B, Brune W, Hengel H, Jonjić S. (2022) Mouse Models for Cytomegalovirus Infections in Newborns and Adults. Curr Protoc. 2(9):e537.
4. Piersma SJ, Brizić I. (2021) Natural killer cell effector functions in antiviral defense. FEBS J. doi: 10.1111/febs.16073.
5. Brizić I, Šušak B, Arapović M, Huszthy PC, Hiršl L, Kveštak D, Juranić Lisnić V, Golemac M, Pernjak Pugel E, Tomac J, Oxenius A, Britt WJ, Arapović J, Krmpotić A, Jonjić S. (2018) Brain-resident memory CD8+ T cells induced by congenital CMV infection prevent brain pathology and virus reactivation. Eur J Immunol. 48(6):950-964.

Istraživačka grupa za staničnu fiziologiju

Zavod za fiziologiju, imunologiju i patofiziologiju

Istraživačka grupa za staničnu fiziologiju bavi se istraživanjem fizioloških mehanizama i putova membranskog prometovanja u endosomalnom i Golgijevom sustavu. Glavni fokus istraživanja je razjašnjavanje mehanizama kojima citomegalovirus preuređuje membranski sustav stanice u ranoj fazi infekcije i dovodi do stvaranja citoplazmatskog odjeljka za sklapanje viriona (cVAC, cytoplasmic virion assembly compartment), te identifikacija membranskih organela na kojima se odvija sekundarno omatanje novostvorenih virusa. Rad grupe organiziran je kroz tri projekta koje financira Hrvatska zaklada za znanost (HRZZ): Sekundarno omatanje i izlazak beta-herpesvirusa iz stanice (IP-2019-04-9564, voditelj prof. dr. sc. Pero Lučin), Reorganizacija sučelja između ranih endosoma i endosomalnog reciklirajućeg odjeljka u citomegalovirusnoj infekciji (IP-2020-02-2916, voditelj prof. dr. sc. Hana Mahmutefendić Lučin) i Stanični sustav Arf GTPaza u patogenezi citomegalovirusne infekcije (IP-2020-02-1323, voditelj prof. dr. sc. Gordana Blagojević Zagorac).

Odabrane publikacije:

1. Lučin P., Karleuša Lj., Blagojević Zagorac G., Mahmutefendić Lučin H., Pavišić V., Jug Vučko N., Lukanović Jurić S., Marcelić M., Lisnić B., Jonjić S. (2018). Cytomegaloviruses exploit recycling Rab proteins in the sequential establishment of the assembly compartment. Frontiers in Cell and Developmental Biology. https://doi.org/10.3389/fcell.2018.00165.
2. Lučin P., Jug Vučko N., Karleuša Lj., Mahmutefendić Lučin H., Blagojević Zagorac G., Lisnić B., Pavišić V., Marcelić M., Grabušić K., Brizić I., Lukanović Jurić S. (2020). Cytomegalovirus generates assembly compartment in the early phase of infection by perturbation of host-cell factors recruitment at the early endosome/endosomal recycling compartment/trans-Golgi interface. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 8:563607. https://doi.org/10.3389/fcell.2020.563607.
3. Štimac, I.; Jug Vučko, N.; Blagojević Zagorac, G.; Marcelić, M.; Mahmutefendić Lučin, H.; Lučin, P. (2021). Dynamin Inhibitors Prevent the Establishment of the Cytomegalovirus Assembly Compartment in the Early Phase of Infection. Life 2021, 11, 876. https://doi.org/10.3390/life11090876
4. Pavišić V, Mahmutefendić Lučin H, Blagojević Zagorac G, Lučin P. (2021). Arf GTPases Are Required for the Establishment of the Pre-Assembly Compartment in the Early Phase of Cytomegalovirus Infection. Life. 2021; 11(8):867. https://doi.org/10.3390/life11080867
5. Marcelić M, Lučin HM, Begonja AJ, Zagorac GB, Lisnić VJ, Lučin P. (2021). Endosomal Phosphatidylinositol-3-Phosphate-Associated Functions Are Dispensable for Establishment of the Cytomegalovirus Pre-Assembly Compartment but Essential for the Virus Growth. Life. 2021; 11(8):859. https://doi.org/10.3390/life11080859

Zavod za histologiju i embriologiju

Istraživačka grupa: Izbjegavanje imunog odgovora od strane citomegalovirusa  

Prof. dr. sc. Astrid Krmpotić

Članovi grupe: dr. sc. Maja Cokarić Brdovčak, doc. dr. sc. Irena Slavuljica, prof. dr. sc. Jelena Tomac, dr. sc. Marko Šustić, Jelena Materljan, dr. med. (doktorandica), Lydia Gaćina, mag. biol. exp. (doktorandica), Dijana Rumora, lab. ing. Istraživačka grupa bavi se imunobiologijom citomegalovirusne (CMV) infekcije, na modelu mišjeg CMV-a (MCMV-a), s posebnim naglaskom na mehanizme kojima CMV izbjegava imuni odgovor domaćina. Budući da MCMV negativno regulira izražavanje liganada za nekoliko kostimulacijskih receptora CD8 limfocita T, u sklopu Hrvatsko-švicarskog programa istraživanja, zajedno sa grupom Dr. Annette Oxenius s ETH u Zűrichu, ova grupa istražuje klonalnu dinamiku inflacije memorijskih CD8 limfocita T, s naglaskom na ulogu kostimulacijskih molekula. U sklopu projekta Hrvatske zaklade za znanost ispituju mogućnost da se rekombinantni CMV koji izražava ligand za aktivacijski receptor NKG2D, koristi kao cjepivo za sprječavanje kongenitalne infekcije CMV-om s posebnim naglaskom na virus koji izražava ligand H60. U sklopu projekta Hrvatske zaklade za znanost IP-CORONA, rade i na dizajniranju citomegalovirusnog vektorskog cjepiva za SARS-CoV-2. U sklopu UNIRI projekta Sveučilišta u Rijeci istražuju i kako CMV izbjegava imunosni nadzor posredovan receptorom NCR1.

Publikacije:

1. Brdovčak MC, Materljan J, Šustić M, Ravlić S, Ružić T, Lisnić B, Miklić K, Brizić I, Matešić MP, Lisnić VJ, Halassy B, Rončević D, Knežević Z, Štefan L, Bertoglio F, Schubert M, Čičin-Šain L, Markotić A, Jonjić S, Krmpotić A. ChAdOx1-S adenoviral vector vaccine applied intranasally elicits superior mucosal immunity compared to the intramuscular route of vaccination. European Journal of Immunology. 2022.
2. Šustić M, Cokarić Brdovčak M, Lisnić B, Materljan J, Juranić Lisnić V, Rožmanić C, Indenbirken D, Hiršl L, Busch DH, Brizić I, Krmpotić A, Jonjić S. Memory CD8 T cells generated by cytomegalovirus vaccine vector expressing NKG2D ligand have effector-like phenotype and distinct functional features. Frontiers in Immunology. 12:681380, 2021.
3. Angulo G, Zeleznjak J, Martínez-Vicente P, Puñet-Ortiz J, Hengel H, Messerle M, Oxenius A, Jonjic S, Krmpotic A, Engel P, Angulo A. Cytomegalovirus restricts ICOSL expression on antigen presenting cells disabling T cell co-stimulation and contributing to immune evasion. Elife. 10:e59350, 2021.
4. Aguilar OA, Berry R, Rahim MM, Reichel JJ, Popović B, Tanaka M, Fu Z, Balaji GR, Lau TN, Tu MM, Kirkham CL, Mahmoud AB, Mesci A, Krmpotić A, Allan DS, Makrigiannis AP, Jonjić S, Rossjohn J, Carlyle JR. A Viral Immunoevasin Controls Innate Immunity by Targeting the Prototypical Natural Killer Cell Receptor Family. Cell. 169(1):58-71, 2017.
5. Miletic A, Lenartic M, Popovic B, Brizic I, Trsan T, Miklic K, Mandelboim O, Krmpotic A*, Jonjic S*. NCR1-deficiency diminishes the generation of protective murine cytomegalovirus antibodies by limiting follicular helper T-cell maturation. European Journal of Immunology. 47(9):1443-1456, 2017.

Opis istraživanja

Naša grupa istražuje humane izvanstanične vezikule (IV) radi otkrivanja dijagnostičkih i prognostičkih biomarkera. IV-e su sićušne čestice koje stanice izlučuju u izvanstanični proctor (Slika 1). Obavijene su lipidnim dvoslojem nalik staničnoj membrani, a uz membranske lipide i proteine mogu sadržavati različite molekule u svojoj hidrofilnoj unutrašnjosti poput proteina, nukleinskih kiselina i metabolita. Koje će molekule biti sadržaj IV-a ovisi o vrsti stanice i njenom trenutnom (pato)fiziološkom statusu. Stoga je molekulski sastav IV-a dinamičan i može poslužiti kao izvor biomarkera, jer IV odražavaju vrstu i stanje tkiva iz kojeg potječu.

Dodatna karakteristika IV-a korisna za njihov biomarkerski potencijal je što IV dospijevaju u tjelesne tekućine. Navedene osobine IV-a čine temelj za tekućinsku biopsiju, koja bi mogla biti primjenjiva za praćenje stanja čak i unutrašnjih organa, kojima je pristup otežan ili možda uopće nije moguć.

Trenutno se fokusiramo na istraživanje IV-a iz cerebrospinalne tekućine bolesnika s traumatskom ozljedom mozga. Traumatsku ozljedu mozga uzrokuje fizikalno oštećivanje moždanog tkiva, koje pokreće daljnji niz patoloških promjena u oštećenju mozga. Naši rezultati ukazuju da bi IV-e mogle biti nositelji proteina i miRNA nužnih za rano pokretanje procesa u svrhu oporavka moždanog tkiva.

Vizualni sažetak:

Slika 1. Mikrovezikule, egzosomi i apoptotska tjelešca su samo neke od izvanstaničnih vezikula (IV) koje različite stanice mogu izlučivati u izvanstanični prostor. Molekulski sadržaj IV-a može biti vrlo raznolik i povrh lipida i proteina može uključivati i nukleinske kiseline i metabolite. IV-e mogu na različite načlne ulaziti u interakcije s recipijentnom stanicom i mijenjati njeno ponašanje.

Autor slike: Vedrana Krušić Alić.

Članovi tima:

Publikacije

• Lara Valenčić Seršić, Vedrana Krušić Alić, Maša Biberić, Siniša Zrna, Tin Jagoić, Janja Tarčuković, and Kristina Grabušić, Real-Time PCR Quantification of 87 miRNAs from Cerebrospinal Fluid: miRNA Dynamics and Association with Extracellular Vesicles after Severe Traumatic Brain Injury, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(5), 4751; https://doi.org/10.3390/ijms24054751
• Mario Kurtjak, Sami Kereïche, Damir Klepac, Hrvoje Križan, Marko Perčić, Vedrana Krušić Alić, Teja Lavrin, Metka Lenassi, Karmen Wechtersbach, Nika Kojc, Marija Vukomanović, Siniša Zrna, Maša Biberić, Robert Domitrović, Kristina Grabušić, and Mladenka Malenica, Unveiling the Native Morphology of Extracellular Vesicles from Human Cerebrospinal Fluid by Atomic Force and Cryogenic Electron Microscopy, MDPI Biomedicines 2022, 10, 1251. https://doi.org/10.3390/biomedicines10061251
• Vedrana Krušić Alić, Mladenka Malenica, Maša Biberić, Siniša Zrna, Lara Valenčić, Aleksandar Šuput, Lada Kalagac Fabris, Karmen Wechtersbach, Nika Kojc, Mario Kurtjak, Natalia Kučić and Kristina Grabušić, Extracellular Vesicles from Human Cerebrospinal Fluid Are Effectively Separated by Sepharose CL-6B—Comparison of Four Gravity-Flow Size Exclusion Chromatography Methods, Biomedicines. 2022 Mar 27;10(4):785. doi: 10.3390/biomedicines10040785.
• Mladenka Malenica, Marija Vukomanović, Mario Kurtjak, Valentina Masciotti, Simone dal Zilio, Silvio Greco, Marco Lazzarino, Vedrana Krušić, Marko Perčić, Ivana Jelovica Badovinac, Karmen Wechtersbach, Ivona Vidović, Vanja Baričević, Srećko Valić, Pero Lučin, Nika Kojc and Kristina Grabušić, Perspectives of Microscopy Methods for Morphology Characterisation of Extracellular Vesicles from Human Biofluids, Biomedicines. 2021 May 26;9(6):603. doi: 10.3390/biomedicines9060603.
• Kuharić J, Grabusic K, Sotosek Tokmadzic V, Štifter S, Tulić K, Shevchuk O, Lučin P, Šustić A. Severe traumatic brain injury induces early changes in the physical properties and protein composition of intracranial extracellular vesicles. J Neurotrauma. 2019 Jan 15;36(2):190-200. doi: 10.1089/neu.2017.5515. Epub 2018 Aug 10

Zavod za medicinsku fiziku i zaštitu od zračenja Kliničkog bolničkog centra Rijeka

Katedra za medicinsku fiziku i biofiziku Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Rijeci

ISTRAŽIVAČKA GRUPA: Medicinska fizika

Izv. prof. dr. sc. Slaven Jurković

Istraživačku grupu čini desetoro fizičara sa Zavoda za medicinsku fiziku i zaštitu od zračenja KBC Rijeka. Četvoro su doktori znanosti, a petoro ih trenutno provodi svoja doktorska istraživanja. U fokusu grupe su istraživanja vezana za fizikalne aspekata primjene ionizirajućeg zračenja, nuklearne magnetske rezonancije i umjetne inteligencije u medicini. Veliki dio aktivnosti je usmjeren na osmišljavanje i izvođenje istraživanja vezanih za projekte Međunarodne agencije za atomsku energiju (International Atomic Energy Agency, IAEA). To je u posljednjih pet godina rezultiralo objavama više od dvadeset znanstvenih članaka i prikazima više od trideset konferencijskih radova.

Od međunarodnih znanstvenih suradnji valja istaknuti one s Onkološkim inštitutom, Ljubljana, Slovenija; Lund University, Švedska¸ Azienda Ospedaliero Universitaria Maggiore della Carità, Novara, Italija; i Massachusetts General Hospital, Boston, SAD.

Za međunarodnu prepoznatljivost izvrsnosti primjene fizike u medicini ostvarene u Kliničkom bolničkom centru Rijeka Zavod je nagrađen Godišnjom nagradom Grada Rijeke 2020. godine.

Odabrane publikacije:

1. Pribanić, Ivan; Simić, Srđan Daniel; Tanković, Nikola; Dundara Debeljuh, Dea; Jurković, Slaven. Reduction of SPECT acquisition time using deep learning: A phantom study, European Journal of Medical Physics, 111 (2023) https://doi.org/10.1016/j.ejmp.2023.102615
2. Šegedin, Nikola; Hršak, Hrvoje; Dolanski Babić, Sanja; Jurković, Slaven. Determination of volume averaging correction factors using an elliptical absorbed dose model for Gamma Knife Perfexion, Journal of Applied Clinical Medical Physics; 24 (2023), https://doi.org/10.1002/acm2.14109
3. Božanić, Ana; Šegota, Doris; Dundara Debeljuh, Dea; Švabić Kolacio, Manda; Smilović Radojčić, Đeni; Ružić, Katarina; Budanec, Mirjana; Kasabašić, Mladen; Hrepić, Darijo; Valković Zujić, Petra; Brambilla, Marco; Kalra, Mannudeep; Jurković, Slaven. National Reference Levels of CT Procedures dedicated for Treatment Planning in Radiation Oncology, European Journal of Medical Physics, 96 (2022) 123–129, https://doi.org/10.1016/j.ejmp.2022.03.001 
4. Švabić Kolacio, Manda; Brkić, Hrvoje; Faj, Dario; Smilović Radojčić, Đeni; Rajlić, David; Obajdin; Nevena; Jurković, Slaven. Validation of two calculation options built in Elekta Monaco Monte Carlo based algorithm using MCNP code. Radiation physics and chemistry, 179 (2021), https://doi.org/10.1016/j.radphyschem.2020.109237
5. Smilović Radojčić, Đeni; Casar, Božidar; Rajlić, David; Švabic Kolacio, Manda; Mendez, Ignasi; Obajdin, Nevena; Dundara Debeljuh, Dea; Jurković, Slaven. Experimental validation of Monte Carlo based treatment planning system in bone density equivalent media. Radiology and oncology, 54 (2020), 4; 495-504   https://doi.org/10.2478/raon-2020-0051

Zavod za medicinsku kemiju, biokemiju i kliničku kemiju

Istraživačka grupa: “Mehanizmi protuupalnog i antitumorskog djelovanja fitokemikalija”

Prof. dr. sc. Robert Domitrović

Članovi grupe: izv. prof. dr. sc. Dijana Detel, izv. prof. dr. sc. Lara Batičić, dr. sc. Iva Potočnjak, dr. sc. Iva Vukelić, dr. sc. Sunčica Buljević, Lidija Šimić, mag. san. ing.

Naša grupa se bavi istraživanjem mehanizama terapijskog djelovanja fitokemikalija na staničnim i animalnim modelima toksičnog oštećenja bubrega i karcinoma debelog crijeva. Fitokemikalije su farmakološki aktivne tvari koje djeluju ne samo kao antioksidansi već i kao modulatori staničnih signalnih puteva. U istraživanjima smo usmjereni prema apoptozi i autofagiji/mitofagiji te signalnim putevima uključenim u ove procese. Od posebnog interesa nam je mogućnost kemosenzitizacije stanica karcinoma debelog crijeva na kemoterapijska sredstva. Također, planiramo u istraživanjima koristiti nanoenkapsulaciju fitokemikalija s ciljem povećanja njihove bioraspoloživosti, posebno pH-osjetljive nanočestice u tretmanu karcinoma debelog crijeva.

Odabrane publikacije:

1. Potočnjak, Iva; Šimić, Lidija; Gobin, Ivana; Vukelić, Iva; Domitrović, Robert. Antitumor activity of luteolin in human colon cancer SW620 cells is mediated by the ERK/FOXO3a signaling pathway. Toxicology in Vitro, 66 (2020), 104852.
2. Vukelić, Iva; Detel, Dijana; Batičić, Lara; Potočnjak, Iva; Domitrović, Robert. Luteolin ameliorates experimental colitis in mice through ERK-mediated suppression of inflammation, apoptosis and autophagy. Food and Chemical Toxicology, 145 (2020), 111680, 14.
3. Potočnjak, Iva; Marinić, Jelena; Batičić, Lara; Šimić, Lidija; Broznić, Dalibor; Domitrović, Robert. Aucubin protects against cisplatin-induced acute kidney injury in mice via attenuation of oxidative stress, apoptosis and inflammation. Food and Chemical Toxicology, 142 (2020), 111472.
4. Potočnjak, Iva; Šimić, Lidija; Vukelić, Iva; Domitrović, Robert. Oleanolic acid attenuates cisplatin-induced nephrotoxicity in mice through regulation of multiple signaling pathways. Food and Chemical Toxicology, 132 (2019), 110676.
5. Vukelić, Iva; Detel, Dijana; Batičić Pučar, Lara; Potočnjak, Iva; Buljević, Sunčica; Domitrović, Robert.

Chlorogenic acid ameliorates experimental colitis in mice by suppressing signaling pathways involved in inflammatory response and apoptosis. Food and Chemical Toxicology, 121 (2018), 140-150.

Istraživačka grupa: „Neuroimunomodulacija u bolesnika s teškom ozljedom mozga i hemoragičnim moždanim inzultom“

Istraživači: prof. dr. sc. Alan Šustić, dr. med., izv. prof. dr.sc. Vlatka Sotošek, dr. med., izv. prof. dr. sc. Kristina Grabušić, dip. biol., dr. sc. Janja Tarčuković, dr. med., Lara Valenčić, dr. med., dr. sc. Matija Sošić, dr med.

Područje istraživanja usmjereno je na istraživanje promjena u krvi i cerebrospinalnoj tekućini bolesnika s teškom ozljedom mozga i hemoragičnim moždanim inzultom. Bolesnici s teškom ozljedom mozga i opsežnim hemoragičnim inzultom su životno ugroženi bolesnici u kojih je došlo do oštećenja strukture i funkcije mozga. Moždano oštećenje koje nastaje u ovih bolesnika pokreće čitav niz kaskadnih reakcija koje rezultiraju oštećenjem moždanih stanica što ima za posljedicu sekundarnu ozljedu mozga. Oštećenja moždanih struktura odražavaju se i na sustavnoj razini te se u ovih bolesnika tijek liječenja često komplicira razvojem sustavnih infekcija.

Istraživačka grupa proučava složene mehanizme koji se događaju na sustavnoj i lokalnoj razini neposredno nakon moždanog oštećenja te tijekom liječenja bolesnika. Glavni fokus istraživanja je analiza dinamičkih promjena imunoloških čimbenika te ekstracelularnih vezikula u cerebrospinaloj tekućini i krvi bolesnika te njihova uloga u složenim patofiziološkim zbivanjima. Grupa istražuje potencijalnu ulogu topljivih čimbenika te ekstracelularnih vezikula u kao potencijalnih biomarkera u prognozi i liječenju bolesnika s moždanim oštećenjem.

Odabrane publikacije:

1. Mrakovcic-Sutic I, Sotosek Tokmadzic V, Laskarin G, Mahmutefendic H, Lucin P, Zupan Z, SusticA. Early changes in frequency of peripheral blood lymphocyte subpopulations in severe traumatic brain-injured patients. Scand J Immunol 2010;72:57-65.
2. Sotosek Tokmadzic V, Laskarin G, Mahmutefendic H, Lucin P, Mrakovcic-Sutic I, Zupan Z, SusticA. Expression of cytolytic protein – perforin – in peripheral blood lymphocytes in severe traumatic brain injured patients. Injury, Int. J. Care Injured 2012;43:624-31.
3. Kuharić J, Grabusic K, Sotosek Tokmadzic V, Štifter S, Tulić K, Shevchuk O, Lučin P, Šustić A. Severe traumatic brain injury induces early changes in the physical properties and protein composition of intracranial extracellular vesicles. J Neurotrauma 2019; 15;36(2):190-200. doi: 10.1089/neu.2017.5515.
4. Matas M, Sotošek V, Kozmar A, Likić R, Sekulić A. Effect of local anesthesia with lidocaine on perioperative proinflammatory cytokine levels in plasma and cerebrospinal fluid in cerebral aneurysm patients: Study protocol for a randomized clinical trial. Medicine (Baltimore) 2019;98(42):e17450.
5. Sošić M, Antončić I, Tarčuković J, Dunatov S, Šustić A, Ćurko-Cofek B, Sotošek V. Effect of intraventricularly administered low-dose recombinant tissue plasminogen activator on interleukin 1-beta and transforming growth factor beta concentrations in cerebrospinal fluid of patients with primary intracerebral hemorrhage associated with intraventricular hemorrhage: A retrospective study.Medicine (Baltimore) 2020;99(20):e19966.

Zavod za temeljnu i kliničku farmakologiju s toksikologijom

Patofiziologija i farmakoterapija traume i ishemije mozga

Voditeljica istraživačke grupe:
Prof. dr. sc. Kristina Pilipović, dr. med.

Članovi grupe: 
Prof. dr. sc. Jasenka Mršić-Pelčić, dr. med.
Prof. dr. sc. Jasna Križ, dr. med.
Doc. dr. sc. Petra Dolenec, dipl. ing. biol., prof. biol.
Doc. dr. sc. Anja Harej Hrkać, mag. bioteh. in med.
Dr. sc. Tamara Janković, dipl. sanit. ing.
Dr. sc. Jelena Rajič Bumber, dipl. inž. biol.
Nika Gržeta, mag. bioteh. in med.
Iva Kristić, dipl. sanit. ing.

Istraživački tim pod vodstvom prof. dr. sc. Kristine Pilipović fokusiran je na otkrivanje patoloških i patofizioloških temelja različitih stanja povezanih s oštećenjem središnjeg živčanog sustava. Istraživanja se protežu na izučavanje i procjenu potencijalnih farmakoterapijskih intervencija za ova stanja. Prvobitno formiran u sklopu istraživačkog projekta Hrvatske zaklade za znanost, “Jednozidne ugljikove nanocjevčice u eksperimentalnoj traumatskoj ozljedi mozga” (CarNanoTBI), djelokrug tima je proširen. Osim istraživanja u području traumatske ozljede mozga, proučavamo i patofiziološku podlogu razvoja neurodegenerativnih promjena koje su posljedica ishemije mozga i epilepsije. Tim također istražuje utjecaj kroničnih bolesti izvan središnjeg živčanog sustava, poput dijabetesa, na strukturne i funkcionalne promjene u mozgu. Nadalje, proučavamo i potencijalne farmakoterapijske strategije za liječenje navedenih oboljenja. Tim želi istražiti nove indikacije za etablirane lijekove i procijeniti farmakološki potencijal prirodnih (biljnih) spojeva koji su nedovoljno istraženi u ovim patologijama.

Vizualni sažetak:

Publikacije:

1. Gržeta Krpan N, Harej Hrkać A, Janković T, et al. Chemically Functionalized Single-Walled Carbon Nanotubes Prevent the Reduction in Plasmalemmal Glutamate Transporter EAAT1 Expression in, and Increase the Release of Selected Cytokines from, Stretch-Injured Astrocytes in Vitro. Cells. 2024;13(3):225.
2. Pilipović K, Jurišić Grubešić R, Dolenec P, Kučić N, Juretić L, Mršić-Pelčić J. Plant-Based Antioxidants for Prevention and Treatment of Neurodegenerative Diseases: Phytotherapeutic Potential of Laurus nobilis, Aronia melanocarpa, and Celastrol. Antioxidants (Basel). 2023;12(3):746.
3. Janković T, Dolenec P, Rajič Bumber J, et al. Differential Expression Patterns of TDP-43 in Single Moderate versus Repetitive Mild Traumatic Brain Injury in Mice. Int J Mol Sci. 2021;22(22):12211.
4. Rajič Bumber J, Pilipović K, Janković T, et al. Repetitive Traumatic Brain Injury Is Associated With TDP-43 Alterations, Neurodegeneration, and Glial Activation in Mice. J Neuropathol Exp Neurol. 2021;80(1):2-14.
5. Mršić-Pelčić J, Pilipović K, Pelčić G, Vitezić D, Župan G. Decrease in Oxidative Stress Parameters after Post-Ischaemic Recombinant Human Erythropoietin Administration in the Hippocampus of Rats Exposed to Focal Cerebral Ischaemia. Basic Clin Pharmacol Toxicol. 2017;121(6):453-464.

Centar za proteomiku

Istraživačka grupa „Patogeneza citomegalovirusne infekcije i imuni odgovor u jajnicima“

izv. prof. dr.sc. Vanda Juranić Lisnić

Članovi grupe: dr.sc. Jelena Marija Mazor, dr.sc. Jelena Železnjak, Magdalena Medved (doktorandica), Tina Ružić, izv.prof.dr.sc. Berislav Lisnić

Grupa se bavi: Patogenezom citomegalovirusne infekcije i imunim odgovorom u jajnicima, te mehanizmima kojim citomegalovirusi moduliraju antigensku prezentaciju. Tijekom 2020. i 2021. godine u suradnji sa KBCRI provodili smo dijagnostiku SARS-CoV-2 u Centru za proteomiku Medicinskog fakulteta u Rijeci za potrebe KBCRI, te razvili Point-of-Care modifikaciju kvantitativnog PCRa koji smo potom implementirali u svakodnevni rad KBCRI na OHBP Sušak u Laboratoriju za brzu molekularnu dijagnostiku u hitnoj medicini. Od 2017. do veljače 2022. provela sam kao voditelj jedan projekt Hrvatske zaklade za znanosti, veliki kolaborativni projekt Njemačke-zaklade za znanost kao su-voditelj i četiri potpora Sveučilišta u Rijeci, ukupnog iznosa projekata cca 260 000 EUR.

Publikacije:

1. Pavletić M, Mazor M, Lerga M, Mileta T, Železnjak J, Ružić T, Ravlić S, Palčevski D, Kirinčić J, Mežnarić S, Mišković A, Materljan M, Šustić A, Lisnić B, Juranić Lisnić V. (2021). Fast, Reliable, and Simple Point-of-Care-like Adaptation of RT-qPCR for the Detection of SARS-CoV-2 for Use in Hospital Emergency Departments. Viruses, 13(12), 2413.
2. Tomac J, Mazor M, Lisnić B, Golemac M, Kveštak D, Bralić M, Bilić Zulle L, Brinkmann MM, Dölken L, Reinert LS, Paludan SR, Krmpotić A, Jonjić S, Juranić Lisnić V. (2021). Viral infection of the ovaries compromises pregnancy and reveals innate immune mechanisms protecting fertility. Immunity 54(7):1478-93.e6.
3. Železnjak J*, Lisnić VJ*, Popović B, Lisnić B, Babić M, Halenius A, L’Hernault A, Roviš TL, Hengel H, Erhard F, Redwood AJ, Vidal SM, Dölken L, Krmpotić A, Jonjić S. (2019).The complex of MCMV proteins and MHC class I evades NK cell control and drives the evolution of virus-specific activating Ly49 receptors.J Exp Med. 5;216(8):1809-1827.
4. Goodier MR, Jonjić S, Riley EM, Juranić Lisnić V. (2018). CMV and natural killer cells: shaping the response to vaccination. Eur J Immunol. 48(1):50-65.
5. Zeleznjak J, Popovic B, Krmpotic A, Jonjic S, Lisnic VJ. (2017.). Mouse cytomegalovirus encoded immunoevasins and evolution of Ly49 receptors – Sidekicks or enemies? Immunol Lett.;189:40-47

Zavod za mikrobiologiju i parazitologiju

Istraživačka grupa: „Patogeneza medicinski relevantnih bakterijskih infekcija“

prof. dr.sc. Maja Abram

Članovi grupe: prof. dr. sc. Darinka Vučković, prof. dr. sc. Brigita Tićac, izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin, izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje, dr. sc. Dolores Peruč, Davorka Repić, dr. med.

Multidisciplinarna istraživačka skupina na Zavodu za mikrobiologiju i parazitologiju već se godinama bavi eksperimentalnom bakteriologijom, odnosno problemom patogeneze medicinski relevantnih bakterijskih infekcija, postižući međunarodno priznate rezultate. Fokus znanstvenih aktivnosti je identifikacija i ispitivanje genetskih, funkcionalnih i strukturnih karakteristika odabranih bakterija (Listeria, Campylobacter, Pseudomonas i dr.), uključujući sposobnost formiranja biofilma i bakterijske komunikacije, interakcije među raznolikim bakterijama te imunološke interakcije između domaćina i patogena. Ispitujemo bakterijsku raznolikost, populacijsku strukturu i antimikrobnu rezistenciju klinički značajnog biofilma koristeći tradicionalne mikrobiološke metode, sonikaciju i kulturomiku te molekularne tehnike uključujući sekvenciranje nove generacije. Aktivno istražujemo nove, alternativne pristupe u inhibiciji stvaranja te razaranju bakterijskog biofilma odabranih bakterija. Istražujemo učinak prirodnih sredstava (eterična ulja, biljni ekstrakti i fitokemikalije), antibiotika, dezinficijensa i njihovih kombinacija i fotodinamički učinak različitih molekula (porfirini, mikročestice cinkovog oksida) na biofilm višestrukorezistentnih patogena. Razumijevanjem mehanizama bakterijske virulencije nastojimo definirati nove mete za učinkovitu prevenciju i antimikrobnu terapiju, kao i nove pristupe u sanitaciji.

Odabrane publikacije:

1. Klančnik, Anja; Gobin, Ivana; Jeršek, Barbara; Smole Možina, Sonja; Vučković, Darinka; Tušek Žnidarič, Magda; Abram, Maja. Adhesion of Campylobacter jejuni Is Increased in Association with Foodborne Bacteria. Microorganisms. 2020;8:201, 14 doi:10.3390/microorganisms8020201
2. Bubonja-Šonje, Marina; Matovina, Mihaela; Škrobonja, Ivana; Bedenić, Branka; Abram, Maja. Mechanisms of carbapenem resistance in multi drug resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa from a Croatian hospital. Microbial drug resistance-mechanisms epidemiology and disease. 2015;21(3): 261-269 doi:10.1089/mdr.2014.0172
3. Bubonja Sonje, Marina; Giacometti, Jasminka; Abram, Maja. Antioxidant and antilisterial activity of olive oil, cocoa and rosemary extract polyphenols. Food chemistry. 2011;127(4):1821-1827 doi:10.1016/j.foodchem.2011.02.071
4. Mihaljević, Roberta; Šikić, Maja; Klančnik, Anja; Brumini, Gordana; Smole Možina, Sonja; Abram, Maja. Environmental stress factors affecting survival and virulence of Campylobacter jejuni. Microbial Pathogenesis. 2007;43 (2-3):120-125
5. Bubonja, Marina; Wraber, Branka; Brumini, Gordana; Gobin, Ivana; Veljković, Danijela; Abram, Maja. Systemic and Local CC Chemokines Production in a Murine Model of Listeria monocytogenes Infection. Mediators of inflammation. 2006; 2006(3):54202. doi: 10.1155/MI/2006/54202.

Zavod za mikrobiologiju i parazitologiju

Istraživačka grupa: „Patogeneza tularemije i legionarske bolesti“

prof. dr.sc. Marina Šantić

Članovi grupe: doc. dr. sc. Mateja Ožanič, doc. dr. sc. Mirna Mihelčić, dr. sc. Valentina Marečić, Ina Viduka, mag. sanit. ing, Maša Knežević, mag. pharm. inv.

Područje istraživanja usredotočeno je na staničnu biologiju te patogenezu tularemije i legionarske bolesti. Francisella tularensis je gram-negativna, visoko infektivna, fakultativno unutarstanična bakterija koja, u životinja i ljudi, uzrokuje tularemiju. Bakterija Legionella pneumophila ulazi i razmnožava se u stanicama makrofaga uzrokujući atipičnu upalu pluća poznatu kao legionarska bolest. U vodenom okolišu, Legionella se razmnožava unutar ameba, što je bitno za prijenos na čovjeka.

Istraživačka grupa pručava mehanizme iskorištavanja biologije stanice domaćina od strane ovih dvaju unutarstaničnih bakterijskih patogena, a što je bitno za razumijevanje patogeneze bolesti. Glavne teme istraživanja su molekularni mehanizmi sazrijevanja unutarstaničnih odjeljaka (fagosom i vakuola) u procesu autofagije, mehanizmi imunološke interakcije između domaćina i patogena, mehanizmi smrti stanice i sposobnosti preživljavanja u amebama kroz duži vremenski period. Glavni fokus je na razumijevanju čimbenika virulencije koji omogućuju legioneli i franciseli da manipuliraju biologijom stanice domaćina i proliferiraju intracelularno. Ovi bakterijski čimbenici su potencijalne mete za nove antibiotike, za prevenciju i cijepljenje. Istraživanja uključuju in vitro, in vivo modele infekcije, kao i okolišne i humane uzorke.

Odabrane publikacije:

1. Knežević M, Rončević D, Vukić Lušić D, Mihelčić M, Kogoj R, Keše D, Glad M, Cenov A, Ožanič M, Glažar Ivče D, Šantić M. Decreasing Pasteurization Treatment Efficiency against Amoeba-Grown Legionella pneumophila-Recognized Public Health Risk Factor. Int J Environ Res Public Health. 2022 Jan 19;19(3):1099. doi: 10.3390/ijerph19031099.
2. Ozanic M, Marecic V, Knezevic M, Kelava I, Stojková P, Lindgren L, Bröms JE, Sjöstedt A, Abu Kwaik Y, Santic M. The type IV pili component PilO is a virulence determinant of Francisella novicida. PLoS One. 2022 Jan 25;17(1):e0261938. doi: 10.1371/journal.pone.0261938.
3. Kelava I, Mihelčić M, Ožanič M, Marečić V, Knežević M, Ćurlin M, Štifter S, Sjöstedt A, Šantić M. Atg5-Deficient Mice Infected with Francisella tularensis LVS Demonstrate Increased Survival and Less Severe Pathology in Internal Organs. Microorganisms. 2020 Oct 6;8(10):1531.
4. Marecic V, Shevchuk O, Ozanic M, Mihelcic M, Steinert M, Jurak Begonja A, Abu Kwaik Y, Santic M. Isolation of F. novicida-Containing Phagosome from Infected Human Monocyte Derived Macrophages. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jul 5;7:303. doi: 10.3389/fcimb.2017.00303. eCollection 2017.
5. Ozanic M, Marecic V, Abu Kwaik Y, Santic M. The Divergent Intracellular Lifestyle of Francisella tularensis in Evolutionarily Distinct Host Cells.PLoS Pathog. 2015 Dec 3;11(12):e1005208. doi: 10.1371/journal.ppat.1005208. eCollection 2015 Dec.

Katedra za društvene i humanističke znanosti u medicini

Istraživačka grupa: „POVIJEST MEDICINE“

Istraživačka skupina Povijest medicine koju čine Toni Buterin, Robert Doričić, Igor Eterović i Amir Muzur (voditelj) s Katedre za društvene i humanističke znanosti u medicini Fakulteta, temelji svoj rad na bogatoj tradiciji riječke povijesnomedicinske škole. U njenome su istraživačkom fokusu prošlost zdravstva u Rijeci i široj regiji te doprinos nositelja riječke medicine napretku profesije na nacionalnoj i globalnoj razini. Članovi skupine jezgra su uredništva znanstvenog časopisa AMHA – Acta medico-historico Adriatica, čiji su suizdavači Hrvatsko znanstveno društvo za povijest zdravstvene kulture i Fakultet, te uredništva knjižnog niza Biblioteka Alumni MedRi posvećenog znanstvenim i drugim postignućima alumna Fakulteta. Među značajnijim projektima ističu se izložba povodom 65. obljetnice osnivanja Fakulteta i projekt Usmena povijest riječkog medicinskog fakulteta. Posebnu pažnju skupina posvećuje čuvanju te kontinuiranom obogaćivanju zbirke predmeta iz ostavština značajnih pojedinaca riječke medicinske povjesnice. (Su)organizacijom prigodnih izložbi i promocijom knjiga članovi skupine redovito sudjeluju u programu Dana Medicinskog fakulteta.

Odabrane publikacije:

1. Muzur A. 2013. Nezavršena povijest medicine u Rijeci: priča o gradu, ljudima i profesiji. Rijeka: Medicinski fakultet Sveučilišta u Rijeci/Hrvatsko znanstveno društvo za povijest zdravstvene kulture/Naklada Kvarner.
2. Muzur A. 2014. Skica za povijest ljekarništva u Rijeci: od najranijih početaka do kraja Drugog svjetskoga rata. Farmaceutski glasnik 70 (11), 827-837.
3. Doričić R, Buterin T, Eterović I, Muzur A. 2019. Rijeka and Its surroundings in 1918-1919: The public impact and the image of the epidemic. History in Flux 1, 123-133.
4. Buterin T, Glažar B, Muzur, A. 2019. Zvonimir Maretić (1921-1989): The history of discovery of the first European antilatrodectic serum and its preparator on the occasion of the 30^th anniversary of his death. Acta medico-historica Adriatica 17 (2), 285-294.
5. Kranjčević J, Muzur A. 2020. Vojna lječilišta na Kvarneru u Austrougarskoj monarhiji i briga za unapređenje časničkog zdravlja. Acta medico-historica Adriatica 18 (1), 129-148.

Zavod za histologiju i embriologiju

Istraživačka grupa: Prepoznavanje i imunološki odgovor na stanični stres uzrokovan metaboličkim promjenama i virusnim infekcijama

Prof. dr. sc. Bojan Polić, dr. med

Članovi grupe: dr. sc. Marko Šestan, dr. med. vet., dr. sc. Vedrana Jelenčić, mag. ing. bioteh., dr. sc. Maja Lenartić, dipl. ing. biol. Mol., Ante Benić, mag. biol. Mol., Karlo Mladenić, mag. bioteh. in med., Sanja Mikašinović, mag bioteh. in med., Vanna Imširović, mag bioteh. in med.

Istraživačka skupina provodi temeljna i translacijska istraživanja u području imunologije. Glavne teme istraživanja odnose se na istraživanja: 1. uloge NKG2D receptora u razvoju, homeostazi i izvršnim funkcijama imunoloških stanica; 2. mehanizama imunološkog prepoznavanja metaboličkog stresa i razvoja kroničnih upalnih bolesti; te 3. mehanizama interakcije imunološkog i endokrinog sustava u virusnim infekcijama. Moja istraživačka skupna je razvila miševe sa konvencionalnom i kondicionalnom deficijencijom NKG2D koje koristimo u našim istraživanjima. Rezultati istraživanja pokazuju važnu ulogu NKG2D u kontroli aktivnosti drugih aktivacijskih receptora (NKp46 i CD16) i edukaciji stanica NK tijekom njihovog razvoja. To je novi mehanizam edukacije stanica NK koji je nezavisan od klasičnog načina edukacije koja koristi inhibicijske receptore. Pored toga, pokazali smo ulogu NKG2D u generiranju memorijskih CD8⁺ limfocita T u odgovoru na virusne infekcije, kao i u ranom razvoju limfocita B1. U ovom području surađujemo sa više međunarodnih znanstvenih grupa što je rezultiralo sa brojnim značajnim znanstvenim publikacijama. Pored navedenoga, istražujemo i mehanizme imunološkog prepoznavanje metaboličkog stresa u debljini koji dovodi do kroničnih upalni bolesti kao što su šećerna bolest tipa 2 i MAFLD. Otkrili smo da debljina dovodi do metaboličkog stresa adipocita koji se manifestira pojačanom ekspresijom NKp46 liganada. To aktivira stanice NK u visceralnom masnom tkivu što dovodi do lučenja IFNg koji pokreće upalu i sistemsku rezistenciju na inzulin. U kontekstu ove teme istražujemo i mehanizam rane aktivacije imunološkog sustava u modelu za MAFLD gdje važnu ulogu u prepoznavanju stresa i razvoju bolesti imaju NKG2D receptor i gd limfociti T. U posljednjih nekoliko godina istražujemo i mehanizme interakcije između imunološkog i endokrinomg sustava u virusnim infekcijama i kako te interakcije djeluju na kontrolu glukoze u krvi i obranu od virusne infekcije. Otkrili smo da IFNg induciran blagom virusnom infekcijom dovodi do inzulinske rezistencije u skeletnim mišićima. To dovodi od kompenzatorne hiperinzulinemije kako bi se održala euglikemija i kako bi se pojačao antivirusni odgovor posredovan CD8⁺ limfocitima T. No, u osoba sa predijabetesom ovaj mehanizam dovodi do hiperglikemije i razvoja šećerne bolesti tipa 2.

Odabrane publikacije:

1. Zafirova B, Mandarić S, Antulov R, Krmpotić A, Jonsson H, Yokoyama WM, Jonjić S, Polić B. (2009) Altered NK cell development and enhanced NK cell-mediated resistance to mouse cytomegalovirus in NKG2D-deficient mice. Immunity 31:270 – 282
2. Wensveen FM, Lenartić M, Jelenčić V, Lemmermann NAW, ten Brinke A, Jonjić S, and Polić B (2013) NKG2D Induces Mcl-1 Expression and Mediates Survival of CD8 Memory T Cell Precursors via Phosphatidylinositol 3-Kinase. J Immunol. 191:1307-15.
3. Wensveen FM, Jelenčić V, Valentić S, Šestan M, Wensveen TT, Theurich S, Glasner A, Mendrila D, Štimac D, Wunderlich FT, Brüning JC, Mandelboim O, Polić B. (2015) NK cells link obesity-induced adipose stress to inflammation and insulin resistance. Nat. Immunol. 16:376-385.
4. Šestan M, Marinović S, Kavazović I, Cekinović Đ, Wueest S, Turk Wensveen T, Brizić I, Jonjić S, Konrad D, Wensveen FM, Polić B. (2018) Virus-Induced Interferon-γ Causes Insulin Resistance in Skeletal Muscle and Derails Glycemic Control in Obesity. Immunity 49:164-177
5. Jelenčić V., Šestan M., Kavazović I., Lenartić M., MarinovićS., Holmes T.D., Prchal-Murphy M., Lisnić B., Sexl V., Bryceson Y.T., Wensveen F.M., Polić B. (2018) NK cell receptor NKG2D sets activation threshold for the NCR1receptor early in NK cell development. Nat. Immunol. 19:1083–1092

Zavod za molekularnu medicinu i biotehnologiju

Istraživačka grupa: „RAST STANICE“

Prof. dr. sc. Siniša Volarević

Članovi grupe: Doc. dr. sc. Slađana Bursać, dr. sc. Milorad Zjalić, poslijedoktorand, Katarina Budić, doktorand, Ivana Matušić, med. lab. ing., Miljana Uzelac, bacc. med. lab. diagn., nasl. izv. prof. dr. sc. Ivana Mihalek

Istražujemo rast stanice, jedan od temeljnih bioloških procesa. Rast stanice ovisan je o sintezi proteina koja se odvija na ribosomima. Budući da pogreške u sintezi ribosoma mogu uzrokovati kvantitativne i kvalitativne promjene u sintezi proteina te posljedično rezultirati razvojem velikog broja bolesti, pretpostavili smo da u stanicama sisavaca postoje mehanizmi koji otkrivaju pogreške u tom procesu i sprječavaju nastanak patoloških procesa. Upotrebom najmodernijih tehnologija manipulacije gena u mišu otkrili smo takav kontrolni mehanizam (Volarević S et al, Science, 2000). U nastavku naših istraživanja dokazali smo da je tumorski supresor p53 ključna komponenta ovog kontrolnog mehanizma in vivo (Šulić S et al, Genes Dev, 2005). Nakon toga smo karakterizirali posljedice pogrešaka u sintezi ribosoma upotrebom većeg broja genetski modificiranih miševa (Panić L et al, Mol Cell Biol, 2006; Panić L et al, Cell Cycle, 2007; Barkić M et al, Mol Cell Biol, 2009). Molekularni mehanizmi aktivacije tumorskog supresora p53 pogreškama u sintezi ribosoma te važnost ovog signalnog puta u patogenezi zloćudnih tumora predmet je naših istraživanja u proteklih desetak godina (Donati G et al, Oncogene, 2011; Sideridou M et al, J Cell Biol, 2011; Golomb L et al, Mol Cell, 2012; Bursać S et al, PNAS, 2012; Gorgoulis VG et al, Nat Cell Biol, 2013; Oršolić I et al, Oncogene, 2020; Moudry P et al, Cell Death Differ, 2021). Naši su rezultati potaknuli brojne znanstvenike u svijetu na istraživanje opisanog kontrolnog mehanizma, što je već rezultiralo otkrićem njegove uloge u patogenezi nekoliko bolesti u ljudi (sindrom Treacher Collins, anemija Diamond-Blackfan i zloćudni tumori). Surađujemo sa sljedećim vrhunskim znanstvenicima iz inozemstva: Moshe Oren, Carol Prives, Vassilis Gorgoulis, Aristides Eliopoulos, Andre Gerber, Kiu Liu, Massimo Derenzini, George Thomas, Davor Solter, Mikael Lindstorm i Jiri Bartek. Razvijamo nove reagense za istraživanje. Posebno mjesto zauzima proizvodnja monoklonskih i poliklonskih protutijela protiv ribosomskih proteina.

Odabrane publikacije:

1. Oršolić I, Bursać S, Jurada D, Drmić Hofman I, Dembić Z, Bartek J, Mihalek I i Volarević S. Cancer-associated mutations in the ribosomal protein L5 gene dysregulate the HDM2/p53-mediated ribosome biogenesis checkpoint. Oncogene, 2020, 39:3443-3457.
2. Pelletier J, Thomas G, Volarević S. Ribosome biogenesis in cancer: new players and therapeutic avenues. Nat Rev Cancer, 2018, 18:51-63.
3. Bursać S, Cokarić Brdovčak M, Pfannkuchen M, Oršolić I, Golomb L, Zhu Y, Katz C, Daftuar L, Grabušić K, Vukelić I, Filić V, Oren M, Prives C, Volarević S. Mutual protection of ribosomal proteins L5 and L11 from degradation is essential for p53 activation upon ribosomal biogenesis stress. PNAS, 2012, 109:20467-20472.
4. Šulić S, Panić L, Barkić M, Merćep M, Uzelac M, Volarević S. Inactivation of S6 ribosomal protein gene in T lymphocytes activates a p53-dependent checkpoint response. Genes Dev, 2005, 19:3070-3082.
5. Volarević S, Stewart MJ, Ledermann B, Zilberman F, Terracciano L, Montini E, Grompe M, Kozma SC, Thomas G. Proliferation, but not growth, blocked by conditional deletion of 40S ribosomal protein S6. Science, 2000, 288:2045-2047.

Centar za proteomiku

Istraživačka grupa „Razvoj inovativnih protutijela i imunosubverzivni mehanizmi virusa i tumora“ 

prof. dr.sc. Tihana Lenac Roviš

Članovi grupe: izv. prof. dr.sc. Berislav Lisnić, dr.sc. Paola Kučan Brlić, Dubravka Karner, mag. biotech. in med. (doktorandica), Gian Pietro Pietri, ind. pharm. chem. (doktorand)
Grupa se bavi razvojem monoklonskih protutijela i dizajnom rekombinantnih protutijela za različite vrste aplikacija. Potonje uključuje: međudjelovanje virusnih proteina i proteina uključenih u imunološki odgovor, imunoterapiju tumora, dijagnostičke alate temeljene na protutijelima, kristalizaciju pomognutu protutijelima ili sa svrhom određivanja determinantni selektivnosti protutijela. Većina protutijela razvija se u suradnji s inozemnim laboratorijima ili tvrtkama. Osobna ekspertiza uključuje konfokalnu lasersku skenirajuću mikroskopiju i dobro poznavanje strukture proteina i stanične biologije te imunosubverzivnih mehanizama herpesvirusa i tumora. Prof. Lenac Roviš bila je voditeljica radnih paketa u nekoliko većih projekata poput H2020, ZCI, FP7, IRI te je voditeljica drugog za redom HRZZ projekta na kojima se, uz ostalo, financiralo mjesto postdoktoranda i dodatno, drugog za redom HRZZ projekta kojim se financira mjesto doktoranda. Inicijator je dobivanja ISO9001 standarda za proces proizvodnje monoklonskih protutijela u Centru za proteomiku i potpisnik nekoliko patenata koji su prihvaćeni ili u postupku prihvaćanja. Prof. Lenac Roviš glavna je i odgovorna osoba za uspostavu i održavanje kataloga komercijalno dostupnih monoklonskih protutijela Centra za proteomiku (https://capri.com.hr/).

Publikacije:

1. Strazic Geljic I, Kucan Brlic P, Musak L, Karner D, Ambriović-Ristov A, Jonjic S, Schu P, Rovis TL. Viral Interactions with Adaptor-Protein Complexes: A Ubiquitous Trait among Viral Species. Int J Mol Sci. 2021 May 17;22(10):5274. doi: 10.3390/ijms22105274.
2. Strazic Geljic I, Kucan Brlic P, Angulo G, Brizic I, Lisnic B, Jenus T, Juranic Lisnic V, Pietri GP, Engel P, Kaynan N, Zeleznjak J, Schu P, Mandelboim O, Krmpotic A, Angulo A, Jonjic S, Lenac Rovis T. Cytomegalovirus protein m154 perturbs the adaptor protein-1 compartment mediating broad-spectrum immune evasion. Elife. 2020 Jan 13;9. pii: e50803. doi: 10.7554/eLife.50803.
3. Lenac Rovis T, Kucan Brlic P, Kaynan N, Juranic Lisnic V, Brizic I, Jordan S, Tomic A, Kvestak D, Babic M, Tsukerman P, Colonna M, Koszinowski U, Messerle M, Mandelboim O, Krmpotic A, Jonjic S: Inflammatory monocytes and NK cells play a crucial role in DNAM-1-dependent control of cytomegalovirus infection, J Exp Med. 2016 Aug 22;213(9):1835-50. doi: 10.1084/jem.20151899. Epub 2016 Aug 8
4. T. L Rovis, G. Legname: Prion Protein-Specific Antibodies-Development, Modes of Action and Therapeutics Application, Viruses, 2014 Oct 1;6(10):3719-37. doi: 10.3390/v6103719.
5. T. Lenac Rovis, S.M. Bailer, V. R. Pothineni, W. J. Ouwendijk, H. Simic, M. Babic, K. Miklic, S. Malic, M. C. Verweij, A. Baiker, O. Gonzalez, A. von Brunn, R. Zimmer, K. Früh, G. M. Verjans, S. Jonjic, J. Haas: Comprehensive analysis of varicella-zoster virus proteins using a new monoclonal antibody collection.  J Virol. 2013 Jun;87(12):6943-54. doi: 10.1128/JVI.00407-13. Epub 2013 Apr 17

Centar za proteomiku

Istraživačka grupa „Razvoj novih imunoterapijskih protutijela“ 

prof. dr. sc. Stipan Jonjić 

Članovi grupe: dr.sc. Paola Kučan Brlić, dr.sc. Marija Mazor, dr.sc. Lea Hiršl, Vanja Baričević, mag. pharm. inv., dr.sc. Jelena Železnjak, prof.dr.sc. Tihana Lenac Roviš, dr. sc. Daria Kveštak, Karmela Miklić, Suzana Malić 

Grupa prof. dr. sc. Stipana Jonjića već se desetljećima bavi istraživanjem kako bazičnih istraživanja patogeneze virusa i imunog odgovora, tako i primjenom tih saznanja na razvoj imunoterapije. Prof. Jonjić prvi je hrvatski znanstvenik dobitnik prestižnog i vrlo kompetitivnog znanstvenog projekta Europskog istraživačkog vijeća (ERC Advanced grant) te prvi dobitnik tzv. Proof-of-concept projekta. Osim toga, sama istraživačka grupa prof. Jonjića iznjedrila je brojne istraživače koji su osnovali svoje grupe u Hrvatskoj i inozemstvu (primjerice dr.sc. Luka Čičin-Šain na Helmholzovom institutu u Braunschweigu te prof. Pero Lučin, prof. Bojan Polić, prof. Astrid Krmpotić, prof. Tihana Lenac Roviš, izv. prof. Vanda Juranić Lisnić, doc. Ilija Brizić s Medicinskog fakulteta u Rijeci). Finalno, prof. Jonjić član je i Njemačke akademije Znanosti i umjetnosti Leopoldine, Europske mikrobiološke akademije i Academiae Europaeae, a dobitnik je i nagrade za životno djelo Grada Rijeke te Državne nagrade za znanost Hrvatskog sabora za životno djelo.  

Ova istraživačka grupa bavi se razvojem i istraživanjem novih imunoterapeutika baziranih na monoklonskim protutijelima te ispitivanjem njihovog protutumorskog djelovanja korištenjem modela humaniziranog miša. U suradnji sa znanstvenicima s Hebrejskog sveučilišta u Jeruzalemu sa kojima su osnovali spin-off kompaniju „Nectin therapeutics“, već su uspješno razvili nekoliko monoklonskih protutijela usmjerenih na imunološke receptore iz obitelji nektina. Ovi proteini djeluju kao imunološke kontrolne točke (engl. checkpoints) pa se njihovim ciljanjem prevladavaju inhibitorni putevi i omogućuje protutumorsko djelovanje imunoloških stanica. Za vodeći klon, antitijelo protiv poliovirusnog receptora (PVR, CD155), nedavno je podvrgnut zahtjev američkoj Agenciji za hranu i lijekove (FDA) kao istraživački novi lijek (IND). Drugo protutijelo, usmjereno na inhibitorni receptor TIGIT, kojeg je isto otkrila grupa prof. Jonjića i kolege iz Izraela (PNAS, 2009.; EJI, 2013.), trenutno se istražuje u pretkliničkim istraživanjima. Brojna druga protutijela su zaštićena patentima (PCT/IL2019/050508; PCT/IL2020/050047) i intenzivno se testiraju, djelom u okviru ove istraživačke grupe.  

Publikacije:

1. Reches A, Ophir Y, Stein N, Kol I, Isaacson B, Charpak Amikam Y, Elnekave A, Tsukerman P, Kucan Brlic P, Lenac T, Seliger B, Jonjic S, Mandelboim O. Nectin4 is a novel TIGIT ligand which combines checkpoint inhibition and tumor specificity. J Immunother Cancer. 2020. 
2. Kučan Brlić P, Lenac Roviš T, Cinamon G, Tsukerman P, Mandelboim O, Jonjić S. Targeting PVR (CD155) and its receptors in anti-tumor therapy. Cellular and Molecular Immunology, 2018. 
3. Lenac Rovis T, Kucan Brlic P, Kaynan N, Juranic Lisnic V, Brizic I, Jordan S, Tomic A, Kvestak D, Babic M, Tsukerman P, Colonna M, Koszinowski U, Messerle M, Mandelboim O, Krmpotic A, Jonjic S. Inflammatory monocytes and NK cells play a crucial role in DNAM-1–dependent control of cytomegalovirus infection. Journal of experimental medicine, 2016. 
4. Stanietsky N, Simic H, Arapovic J, Toporik A, Levy O, Novik A, Levine Z, Beiman M, Dassa L, Achdout H, Stern-Ginossar N, Tsukerman P, Jonjic S, Mandelboim O. The interaction of TIGIT with PVR and PVRL2 inhibits human NK cell cytotoxicity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009. 
5. Stanietsky N, Rovis TL, Glasner A, Seidel E, Tsukerman P, Yamin R, Enk J, Jonjic S, Mandelboim O. Mouse TIGIT inhibits NK-cell cytotoxicity upon interaction with PVR. Eur J Immunol. 2013.

Voditeljica istraživanja: izv. prof. dr. sc. Petra Valković Zujić, dr. med. sa Katedre za radiologiju

Suradnici: izv. prof. Slaven Jurković, spec. med. fiz. i Doris Šegota Ritoša, prof. fizike i informatike sa Katedre za medicinsku fiziku i biofiziku, doc. dr. sc. Manuela Avirović, dr. med. sa Zavoda za opću patologiju i patološku anatomiju, doc. dr. sc. Jana Katunar, dipl. oec. s Katedre za ekonomiku poduzeća Ekonomskog fakulteta u Rijeci, Nina Bartolović, dr. med. i Mateo Madunić, dr. med. s Katedre za radiologiju te Ana Car Peterko, dr. med. s Katedre za kirurgiju. Suradnici izvan sastavnica Sveučilišta su radiologinje Emina Grgurević Dujmić, dr. med. i Sabina Lenac, dr. med. iz Doma zdravlja Primorsko-goranske županije

Cilj projekta je kroz suradnju akademske zajednice, partnera Dom zdravlja PGŽ i partnera iz gospodarstva detektirati probleme i nedostatke dosadašnjih metoda oslikavanja dojki te predložiti kontrastnu mamografiju kao metodu kojom bi se ubrzala obrada i povećala učinkovitosti određivanjem odnosa troškova u odnosu na druge modalitete oslikavanja. Nadalje, cilj je projekta uspostava dugoročne suradnje istraživačkih centara, dionika te gospodarstva uz diseminaciju znanja, a rezultati istraživanja, uz potvrdu hipoteze, mogu unaprijediti dijagnostiku dojki uz ekonomski prihvatljive uvjete.

U okviru ovog projekta planiraju se sljedeće aktivnosti:
Uz pomoć partnera iz javnozdravstvenog sustava procijenit će se mogućnost implementacije metode kao metode izbora za definiranu skupinu ispitanika.
Na temelju prethodno prikupljenih podataka sa suradnicima sa Ekonomskog fakulteta analizirat će se i financijski učinci CEM metode u smislu efikasnosti troška za javnozdravstveni sustav u komparaciji sa socioekonomskim i financijskim učincima na život i rad pacijentica.
Nakon potvrde hipoteze da je istraživana metoda visoko učinkovita, te su tumori ciljane skupine otkriveni u ranoj fazi, bez odstupanja u učinkovitosti metode u odnosu na MR, elaborirat će se klinički i socioekonomski prednosti i nedostaci, odnosno troškovi i koristi (cost-benefit analiza) uvođenja i primjene metode u kliničku praksu.
Projektna suradnja znanstvenika s više sastavnica UNIRI doprinosi međusobnoj koheziji i boljem razumijevanju rane dijagnoze raka dojke, a interdisciplinarna istraživanja dodatno povezuju dionike iz različitih znanstvenoistraživačkih područja te dionika iz znanosti i industrije.

Publikacije: grupa je uspješno prijavila protokol istraživanja u sklopu projekta na platformu ClinicalTrials.gov ID NCT06217458

Katedra za zdravstvenu ekologiju

Istraživačka grupa „Zaštita mora za kupanje“

izv. prof. dr.sc. Darija Vukić Lušić, dipl.sanit.ing.

Članovi grupe: nasl. doc.dr.sc. Arijana Cenov, dipl.sanit.ing, nasl. doc.dr.sc. Marin Glad, dipl.sanit.ing, izv. prof. dr.sc. Dražen Lušić, dipl.sanit.ing., Neven Sučić, mag.med.lab.diag. (doktorand)

Grupa se bavi: istraživanjem utjecaja različitih okolišnih čimbenika na zdravlje populacije. Poseban interes grupe je područje unaprjeđenja monitoringa kakvoće mora za kupanje. Provodi se usporedba i unaprjeđuju se i razvijaju metode, tehnike i alati praćenja kakvoće mora za kupanje. Testira se primjena ne rutinskih, bržih i preciznijih metoda za praćenje broja indikatora fekalnog onečišćenja u moru (tehnikama kultivacije, definiranog supstrata (DTS) i RT-PCR, upotpunjeno MALDI-TOF MS tehnologijom koja omogućava identifikaciju brojnih okolišnih vrsta). Grupa je u suradnji s kolegom dr.sc. Slavenom Jozić (Institut za oceanografiju i ribarstvo, Split) i drugim kolegama iz ZZJZ priobalnih županija sudjelovala u modifikaciji ISO metode za određivanje E. coli u morskoj vodi. Metoda je odobrena od strane Europske Komisije te ju se može koristiti za određivanje E. coli u vodama za kupanje (more i kopnene vode) na području Republike Hrvatske. U suradnji s kolegama s Tehničkog fakulteta u Rijeci po prvi puta u Hrvatskoj i u regiji razvijen i primijenjen model predviđanja kakvoće mora za kupanje, temeljen na povijesnim podacima o kakvoći mora te vremenskoj prognozi. Grupa sudjeluje na više znanstvenih projekata: 2021 – 2024 HRZZ projekt EUROBATH – Ususret novoj direktivi Europske unije o upravljanju kvalitetom vode za kupanje; 2020 – 2023 EU projekt KLIMOD – Računalni model strujanja, poplavljivanja i širenja onečišćenja u rijekama i obalnim morskim područjima; 2020 – 2023 EU projekt ProtectAs – Razvoj sustava kontrole i obrane luka od unosa stranih vrsta; 2018 – 2023 UNIRI projekti 2018 Prilagodba novoj EU Direktivi o kvaliteti vode za kupanje; 2018 – 2023 UNIRI-plus projekti 2018 Modeliranje krša s javno-zdravstvenim i socio-ekonomskim implikacijama. Rezultati navedenih istraživanja utječu na kreiranje novih regulativa iz predmetnog područja.

Publikacije:

1. Mance, Diana ; Mance, Davor ; Vukić Lušić, Darija Environmental and anthropogenic factors affecting coastal bathing water quality: preliminary study for Primorje-Gorski Kotar County (Croatia) // Pomorstvo : scientific journal of maritime research, 35 (2021), 1; 57-68. doi: 10.31217/p.35.1.7
2. Jozić, Slaven ; Baljak, Vanja ; Cenov, Arijana ; Lušić, Dražen ; Galić, Dominik ; Glad, Marin ; Maestro, Daniel ; Maestro, Nerma ; Kapetanović, Damir ; Kraus, Romina ; Marinac- Pupavac, Sandra ; Vukić Lušić, Darija Inland and coastal bathing water quality in the last decade (2011–2020): Croatia vs. region vs. EU // Water, 13 (2021), 17; 2440, 15. doi: 10.3390/w13172440
3. Topić, Nancy ; Cenov, Arijana ; Jozić, Slaven ; Glad, Marin ; Mance, Diana ; Lušić, Dražen ; Kapetanović, Damir ; Mance, Davor ; Vukić Lušić, Darija Staphylococcus aureus—An Additional Parameter of Bathing Water Quality for Crowded Urban Beaches // International journal of environmental research and public health, 18 (2021), 10; 5234, 13. doi: 10.3390/ijerph18105234
4. Glažar Ivče, Daniela ; Rončević, Dobrica ; Šantić, Marina ; Cenov, Arijana ; Tomić Linšak, Dijana ; Mićović, Vladimir ; Lušić, Dražen ; Glad, Marin ; Ljubas, Davor ; Vukić Lušić, Darija Is a Proactive Approach to Controlling Legionella in the Environment Justified? // Food technology and biotechnology, 59 (2021), 3; 314-324. doi: 10.17113/ftb.59.03.21.7016
5. Jozić, Slaven ; Baljak, Vanja ; Cenov, Arijana ; Lušić, Dražen ; Galić, Dominik ; Glad, Marin ; Maestro, Daniel ; Maestro, Nerma ; Kapetanović, Damir ; Kraus, Romina ; Marinac- Pupavac, Sandra ; Vukić Lušić, Darija Quality of Croatian Inland Bathing Areas: Reference to The Region and EU // Journal of health sciences, 11 (2021), 1; 37-46. doi: 10.17532/jhsci.2021.1110