Mikrobiologija i parazitologija

Pročelnik:
Prof. dr. sc. Marina Šantić, dipl. sanit. ing.
e-mail: marina.santic@medri.uniri.hr
tel: +385 (0)51 651 267

Tajnica:
Sandra Abramović
e-mail: sandra.abramovic@medri.uniri.hr
tel: +385 (0)51 651 145

• Studenti se primaju:
  PON-PET 11:00-13:00

Zavod za mikrobiologiju i parazitologiju osnovan je 1958. godine. Za prvog predstojnika izabran je prof. dr. sc. Vladimir Bezjak koji je tu dužnost obavljao sve do odlaska 1978. Potom, predstojnikom postaje prof. dr. Zvonimir Gall do 1987., zatim prof. dr. sc. Bernarda Ćorić do 1990. te prof. dr. sc. Miljenko Dorić do 2012. godine, kada je za predstojnicu Zavoda izabrana prof. dr. sc. Maja Abram i obavljala tu dužnost do travnja 2024. godine. Sadašnja predstojnica Zavoda za mikrobiologiju i parazitologiju je prof. dr. sc. Marina Šantić

Klinički zavod za kliničku mikrobiologiju KBC-a Rijeka te Odjel za zaštitu okoliša i zdravstvenu ekologiju i Odjel za kliničku mikrobiologiju NZZJZ Primorsko-goranske županije predstavljaju našu nastavnu bazu.

Nastava iz mikrobiologije održava se za studente sveučilišnih studija Medicina (na hrvatskom i engleskom jeziku), Sanitarno inženjerstvo, Medicinsko-laboratorijska dijagnostika i Farmacija. Djelatnici Zavoda provode nastavu na doktorskim studijima Biomedicine i Zdravstveno-ekološkog inženjerstva unutar Doktorske škole iz područja Biomedicine i zdravstva.

Osim nastave za studente sveučilišnih prijediplomskih, diplomskih i poslijediplomskih studija Medicinskog fakulteta u Rijeci nastavnici i suradnici Zavoda uključeni su u nastavu kolegija koji se odvijaju na Fakultetu dentalne medicine (Dentalna medicina-na hrvatskom i engleskom jeziku te Dentalna higijena) i Fakultetu zdravstvenih studija Sveučilišta u Rijeci (Sveučilišni studij Sestrinstva i Sveučilišni studij Primaljstva).

Djelatnici Zavoda sudjeluju u nastavi na Fakultetu zdravstvenih studija, Sveučilišta Mostar, BIH na studijskim programima Preddiplomski i Diplomski studij Sanitarno inženjerstvo, Preddiplomski studij Sestrinstva te Preddiplomski studij Radiološke tehnologije.

Na Zavodu za mikrobiologiju i parazitologiju obavljaju se stručne mikrobiološke usluge za potrebe Klinike za ortopediju Lovran.

Od početka rada naša je misija usmjerena na osiguranje izvrsnosti u obrazovanju, istraživanju u području patogeneze bakterijskih infekcija i podizanju stručnih standarda u mikrobiologiji.

Ciljevi daljnjeg razvitka nastavne i znanstvene djelatnosti Zavoda su kontinuirano unaprjeđivanje kvalitete nastave, znanosti i međunarodne suradnje te jačanje kadrovske strukture kroz zapošljavanje mladih znanstvenika ili asistenata, napredovanje doktora znanosti i viših asistenata, kao i  zapošljavanje naslovnih nastavnika iz KBC Rijeka i NZZJZ PGŽ. 

• Predstojnik
  • Prof. dr. sc. Marina Šantić, dipl. sanit. ing.
    e-mail: marina.santic@medri.uniri.hr

• Nastavno osoblje
  • Prof. dr. sc. Maja Abram, dr. med., redovita profesorica u trajnom zvanju
    e-mail: maja.abram@medri.uniri.hr 
  • Prof. dr. sc. Darinka Vučković, dr. med., redovita profesorica u trajnom zvanju
    e-mail: darinka.vuckovic@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Marina Šantić, dipl. sanit. ing., redovita profesorica u trajnom zvanju
    e-mail: marina.santic@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Brigita Tićac, dr. med., redovita profesorica  
    e-mail: brigita.ticac@medri.uniri.hr 
  • Prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje, dr. med., redovita profesorica 
    e-mail: marina.bubonja@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Ivana Gobin, dipl. sanit. ing., redovita profesorica 
    e-mail: ivana.gobin@uniri.hr  
  • Doc. dr. sc. Bojana Mohar Vitezić, mag. mikrobiol., docentica
    e-mail: bojana.mohar@medri.uniri.hr 
  • Doc. dr. sc. Mirna Mihelčić, dr. vet. med., docentica  
    e-mail: mirna.mihelcic@medri.uniri.hr  
  • Doc. dr. sc. Dolores Peruč, dr. med., docentica 
    e-mail: dolores.peruc@uniri.hr  
  • Dr. sc. Davorka Repac Antić, dr. med., viša asistentica
    e-mail: davorkaar@medri.uniri.hr
  • Dr. sc. Ina Viduka, mag. sanit. ing., viša asistentica
    e-mail: ina.kelava@uniri.hr
  • Dr. sc. Maša Knežević, mag. pharm. inv., viša asistentica
    e-mail: masa.knezevic@medri.uniri.hr
  • Kristina Franjić, dr. med., naslovna asistentica,
    e-mail: kristina.franjic@medri.uniri.hr
  • Ivana Škorobonja, dr. med., naslovna asistentica,
    e-mail: ivana.skrobonja@uniri.hr
  • Katja Lipošćak, dr. med., naslovna asistentica,
    e-mail: katja.liposcak@uniri.hr

• Suradnici
  • Dr. sc. Andreja Zubković, mag. biotechn., viša asistentica na projektu,
    e-mail: andrejaz@uniri.hr  
  • Dr. sc. Mia Cesarec, mag. mol. biol. viša asistentica na projektu
    e-mail: miac@medri.uniri.hr

• Nenastavno osoblje
  • Sandra Abramović, administrativna tajnica;
    e-mail: sandra.abramovic@medri.uniri.hr
  • Dr. sc. Gabrijela Begić, mag. med. lab. diagn., viša laborantica;
    e-mail: gabrijela.begic@uniri.hr
  • Danica Rebić, bacc. med. lab. diagn., viša laborantica;
    e-mail: danica.rebic@medri.uniri.hr
  • Gabriel Tomas, laborant; e-mail: gabriel.tomas@medri.uniri.hr
  • Elena Mitrović, laborantica,
    e-mail: elenam@uniri.hr

Integrirani preddiplomski i diplomski sveučilišni studiji

Medicina

• Medicinska mikrobiologija i parazitologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Klinička mikrobiologija (integrirano s kolegijem Zarazne bolesti) (obvezni)
• Živjeti pod mikroskopom (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Antibiotici – žrtve vlastitog uspjeha (izbornij), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Patogeneza zaraznih bolesti (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje
• Tuberkuloza – prošlost i sadašnjost (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Britiga Tićac
• Primjenjena mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr.sc. Marina Šantić
• Mehanizam djelovanja probiotičkih mikroorganizama (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Parazitarne zoonoze (izborni), voditeljica: doc. dr. sc. Mirna Mihelčić

Medicina na engleskom jeziku

• Medical Microbiology and Parasitology (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Applied Microbiology (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Mechanism of action of probiotic bacteria (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin

Sanitarno inženjerstvo

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Mikrobiologija hrane (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Mikrobiologija voda (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Život pod mikroskopom (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Metode mikroskopije u mikrobiologiji (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić 
• Probiotički mikroorganizmi (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Mikrobne zajednice u okolini (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Oportunistički patogeni u ustanovama zdravstvene skrbi (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin

Medicinsko laboratorijska dijagnostika

• Opća bakteriologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc.  Marina Bubonja Šonje 
• Medicinska bakteriologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Brigita Tićac 
• Medicinska virologija (obvezni), voditeljica: doc. dr. sc. Bojana Mohar Vitezić
• Medicinska parazitologija i mikologija (obvezni), voditeljica: doc. dr. sc. Mirna Mihelčić  
• Klinička mikrobiologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram 
• Mikroskopija i mikroskopske tehnike (izborni), voditeljica: doc. dr. sc. Mateja Ožanič 
• Sterilizacija i dezinfekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc Marina Šantić 
• Stanične kulture (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić 
• Neobični mikrobi u različitim ekosustavima (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin 

Farmacija

• Medicinska mikrobiologija za farmaceute (obvezni), voditeljica:  prof. dr. sc. Brigita Tićac
• Antibiotici žrtve vlastitog uspjeha (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram 

Poslijediplomski doktorski studiji

DOKTORSKA ŠKOLA IZ ZNANSTVENOG PODRUČJA BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO

Studijski program „Biomedicina“

• Patogeneza bakterijskih infekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Visokopatogeni mikroorganizmi (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić i prof. dr. sc. Alemka Markotić
• Funkcionalna svojstva bakterija (metoda br. 18), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin, u sklopu obveznog kolegija “Primjena istraživačkih metoda u znanstvenom radu”

Studijski program „Zdravstveno i ekološko inženjerstvo”

• Mikrobna rezistencija u okolišu (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Prijeteće zoonoze (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić

Poslijediplomski specijalistički studiji

Anesteziologija, reanimatologija i intenzivna medicina

• Klinička mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Hitna medicina

• Klinička mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Osim nastave za studente sveučilišnih dodiplomskih, diplomskih i poslijediplomskih studija Medicinskog fakulteta u Rijeci nastavnici i suradnici Zavoda uključeni su u nastavu kolegija koji se odvijaju na Fakultetu dentalne medicine te Fakultetu zdravstvenih studija Sveučilišta u Rijeci.
Voditelji su sljedećih kolegija:

pri Fakultetu dentalne medicine

Integrirani preddiplomski i diplomski sveučilišni studij Dentalna medicina

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Microbiology and Parasitology (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Prijediplomski sveučilišni studij Dentalna higijena

• Osnove oralne mikrobiologije (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

pri Fakultetu zdravstvenih studija

Prijediplomski stručni studij Sestrinstvo

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Hospitalne infekcije (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje
• Otpornost mikroorganizama na fizikalne i kemijske čimbenike – sterilizacija i dezinfekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić

Prijediplomski stručni studij Primaljstvo

• Opća mikrobiologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Specijalna mikrobiologija u primaljstvu (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković

Diplomski sveučilišni studij Sestrinstvo – menađment u sestrinstvu

• Infekcije povezane sa zdravstvenom skrbi (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Diplomski sveučilišni studij Primaljstvo

• Prevencija i nadzor infekcija povezan sa zdravstvenom skrbi (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje

Aktivni projekti

• “Mehanizmi dugotrajnog preživljavanja Francisella unutar ameba” – (HRZZ-IP-2022-10-8445), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• “Tulamibe” (CNRS2017-5), Istraživački projekt francuske Agencije za znanost (CNRS), voditelj radnog paketa: prof. dr. sc. Marina Šantić.
• “Uloga ∆igIF mutante Francisella tularensis na imuni odgovor u eksperimentalnoj tularemiji” – projekt MEDRI Fonda za potporu istraživačima, voditeljica: dr. sc. Ina Viduka
• “Liofilizacija bakterijske suspenzije s ciljem dugotrajnog skladištenja na višim temperaturama” – projekt MEDRI Fonda za potporu istraživačima, voditeljica: dr. sc. Maša Knežević
• “Preživljavanja i oporavak francizela iz stanica ameba” – UNIRI projekt za iskusne znanstvenike, voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• “Istraživanje i karakterizacija mikrobioma zdravstvene ustanove” – UNIRI projekt za iskusne znanstvenike, voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• “Bakterijski biofilm – izazovi u prevenciji i nove terapijske perspective” – UNIRI projekt za iskusne znanstvenike, voditeljica: prof. dr. sc. Ivana Gobin
• “Distribucija serotipova, genotipova i antimikrobna rezistencija invazivnih izolata Streptococcus pneumoniae u Primorsko-goranskoj županiji” – UNIRI projekt za iskusne znanstvenike, voditeljica: prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje
• “Uloga ΔiglF mutante Francisella tularensis u patogenezi eksperimentalne tularemije” – UNIRI projekt za mlade znanstvenike, voditeljica: dr. sc. Ina Viduka
• “Osjetljivost Francisella na antibiotike nakon dugotrajnih interakcija s A. castellanii” – UNIRI projekt za mlade znanstvenike, voditeljica: dr. sc. Maša Knežević

Završeni projekti u posljednih 10 godina

• “Francisella – molekularni mehanizmi prilagodbe na stanice amebama” (uniri-biomed-18-128), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić, potpora Sveučilišta u Rijeci
• “Bakterijska patogeneza – od istraživanja do kliničke primjene” (uniri-biomed-18-277), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram, potpora Sveučilišta u Rijeci
• “Oportunistički patogeni vodoopskrbnog sustava: novi izazov u obradi voda” (uniri-biomed-18-171), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin, potpora Sveučilišta u Rijeci
• “Proširenost i klinički značaj HBs antigenih mutanti virusa hepatitisa B” (uniri-biomed-18-215), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje, potpora Sveučilišta u Rijeci
• “Uloga lamA gena u dugotrajnom preživljavanju Legionella pneumophila unutar Acanthamoeba castellanii” (uniri-biomed-mladi-20-23), voditeljica: dr. sc. Valentina Marečić, potpora Sveučilišta u Rijeci
• “Francycle” (HRZZ-IP-06-2016-9003) voditeljica: prof. dr sc. Marina Šantić , Hrvatska zaklada za znanost
• “Projekt razvoja karijere mladih istraživača-izobrazba novih doktora znanosti” (DOK-01-2018), voditeljica/mentorica: prof. dr. sc. Marina Šantić, Hrvatska zaklada za znanost
• “Projekt razvoja karijere mladih istraživača-izobrazba novih doktora znanosti” (DOK-09-2018), voditeljica/mentorica: prof. dr. sc. Marina Šantić, Hrvatska zaklada za znanost
• Projekt br. 13.06.1.1.07: “Molekularni mehanizmi bakterijske patogeneze i odgovora na stress” – potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: prof. dr. sc. Maja Abram
• Projekt br. 13.06.1.1.12: “Francisella tularensis – unutarstanični život i patogeneza tularemije u miša” – potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Projekt br. 13.06.2.2.60: “Mehanizmi patogeneze eksperimentalne legioneloze” – potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: doc. dr. sc. Ivana Gobin

10 najvažnijih publikacija u proteklih 5 godina

• D. Peruč, S. Štifter-Vretenar, A. Planinić, I. Gobin: Combined Application of Juniperus communis Essential Oil and Amikacin, Clarithromycin and Firampicin against Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare. Processes, 2024, 12, 111, https://doi.org/10.3390/pr12010111
• M. Bubonja Šonje, D. Peruč, M. Abram, B. Mohar Vitezić: Prevalence of occult hepatitis B viru infection and characterisation of hepatitis B surface antigen mutants among adults in western Croatia. Annals of Hepatology, 29 (2023) 101156, https://doi.org/10.1016/j.aohep.2023.101156
• M. Mušković, M. Planinić, A. Crepulja, M. Lušić, M. Glad, M. Lončarić, N. Malatesti, I. Gobin: Photodynamic inactivation of multidrug-resistant strains of Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa in minicipal wastewater by tetracationic porphyrin and violet-blue light: The impact of wasterwater constituents. Plos One, 2023., https://doi.org/10.1371/journal.pone.0290080
• G. Begić, I. Jelovica Badovinac, Lj. Karleuša, K. Kralik, O. Cvijanović Peloza, D. Kuiš, I. Gobin: Streptococcus salivarius as an Important Factor in Dental Biofilm Homeostasis: Influence on Streptococcus mutans and Aggregatibacter actinomycetemcomitans in Mixed Biofilm. International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24, 7249, https://doi.org/10.3390/ijms24087249
• M. Tomljenović, D. Lakošeljac, L. Knežević, M. Bubonja-Šonje, M. Abram, S. Špičić, M. Zdelar-Tuk, S. Duvnjak, I. Reil, O. Valjin, M. Kramarić, T. Miškić, I. Lohman Janković, D. Rončević: Coxiella burnetii (Q-fever) autbreak associated with non-occupational exposure in a semi-urban area of western Croatia in 2022. Zoonoses Public Health, 2022, 00:1-9, https://doi.org/10.1111/zph.13022
• M. Ožanič, V. Marečić, M. Knežević, I. Kelava, P. Stojkova, L. Lindgren, J. E. Broms, A. Sjostedt, Y. Abu Kwaik, M. Šantić: The type IV pili component PilO is a virulence determinant of Francisella novicida. Plos One, January 25, 2022, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0261938
• D. Peruč, D. Broznić, Ž. Maglica, Z. Marijanović, Lj. Karleuša, I. Gobin: Biofilm Degradation of Nontuberculous Mycobacteria Formed on Stainless Steel Following Treatment with Immortelle (Helichrysum italicum) and Common Juniper (Juniperus communis) Essential Oils. Processes 2021, 9, 362, https://doi.org/10.3390/pr9020362
• M. Knežević, V. Marečić, M. Ožanič, N. Špoljarić, I. Kelava, M. Ćurlin, Y. Abu Kwaik, M. Mihelčić, M. Šantić: Increased Sensitivity of Amoeba-Grown Francisella Specirs to Disinfectants. Microorganisms, 2020, 8, 1260, https://doi.org/10.3390/microorganisms8091260
• D. Peruč, B. Tićac, D. Broznić, Ž. Maglica, M. Šarolić, I. Gobin: Juniperus communis essential oil limit the biofilm formation of Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare on polystyrene in a temperature-dependent manner. International Journal of Environmental Health Research. 20 Mar 2020, doi: 10.1080/09603123.2020.1741519
• D. Peruč, B. Tićac, M. Abram, D. Broznić, S. Štifter, M. Malenica Staver, I. Gobin: Synergistic potential of Juniperus communis and Helichrysum italicum essential oils against nontuberculous mycobacteria. Journal of Medical Microbiology, 2019., doi:10.1099/jmm.0.000962

• Ivana Gobin – Nagrada za nastavnu izvrsnost Sveučiliša u Rijeci u akad. god. 2020./21.
• Valentina Marečić – Nagrada za nastavnu izvrsnost Sveučilišta u Rijeci u akad. god. 2020./21.
• Mateja Ožanič – Nagrade Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici u 2016.
• Mateja Ožanič – Godišnja nagrada Hrvatskog mikrobiološkog društva za mlade znanstvenike za 2016. godinu
• Marina Šantić -Nagrada Primorsko-goranske županije za znanstvena dostignuća u 2010 godini
• Marina Šantić -Nagrada Grada Rijeke za znanstvena dostignuća iz područja biomedicine za godinu 2009.
• Marina Bubonja Šonje – Nagrada Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici za 2006./07.
• Marina Šantić – Državna nagrada za znanost iz područja biomedicinskih zananosti za godinu 2007.
• Marina Šantić – Nagrade Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji asistent znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici za 2005./06.
• Marina Šantić – Priznanje Medicinskog fakulteta, Sveučilišta u Rijeci, kao najboljem mladom znanstveniku za temeljne medicinske znanosti i ostala znanstvena područja u 2005. godini.

Na Zavodu za mikrobiologiju provodi se mikrobiološka dijagnostika periprotetičkih infekcija postupkom sonikacije izvađenih implantata u ultrazvučnoj kupelji. Ultrazvuk pomaže odvajanju adheriranih mikroorganizama sa površine implantata (iz biofilma), u tekućinu koja se onda kultivira. Time se povećava mogućnost izolacije uzročnika infekcije.

Na Zavodu se također pripremaju humani fekalni uzorci koji se zatim dugotrajno pohranjuju u Biobanci koja se nalazi na Medicinskom fakultetu.