Mikrobiologija i parazitologija

Pročelnik:
Prof. dr. sc. Maja Abram, dr. med.
e-mail: maja.abram@medri.uniri.hr
tel: +385 (0)51 651 208

Tajnica:
Sandra Abramović
e-mail: sandra.abramovic@medri.uniri.hr
tel: +385 (0)51 651 145

• Studenti se primaju:
  PON-PET 11:00-13:00

Zavod za mikrobiologiju i parazitologiju osnovan je 1958. godine. Za prvog predstojnika izabran je prof. dr. sc. Vladimir Bezjak koji je tu dužnost obavljao sve do odlaska 1978. Potom, predstojnikom postaje prof. dr. Zvonimir Gall do 1987., zatim prof. dr. sc. Bernarda Ćorić do 1990. te prof. dr. sc. Miljenko Dorić do 2012. godine, kada je za predstojnicu Zavoda izabrana prof. dr. sc. Maja Abram koja tu dužnost obavlja i danas.

Djelatnici Zavoda sudjelovali su u organizaciji i razvoju bakterioloških laboratorija u tadašnjim bolnicama “Dr. Z. Kučić” (1958.) i “Braće dr. Sobol” (1960.), te pomogli organizirati rad parazitološkog laboratorija i laboratorija za tuberkulozu u tadašnjem Zavodu za zaštitu zdravlja u Rijeci. I danas, uz stručnu suradnju, Klinički zavod za kliničku mikrobiologiju KBC-a Rijeka kao i Odjel za mikrobiologiju NZZJZ Primorsko-goranske županije predstavljaju našu nastavnu bazu.

Nastava iz mikrobiologije održava se za studente sveučilišnih studija Medicina, Sanitarno inženjerstvo, Medicinsko laboratorijska dijagnostika, Farmacija kao i znanstvenih i stručnih poslijediplomskih studija. Osim toga, pri Zavodu za mikrobiologiju održava se nastava za studente sveučilišnih studija Dentalna medicina i Dentalna higijena pri Fakultetu dentalne medicine te za studente stručnih i sveučilišnih studija Sestrinstva i Primaljstva pri Fakultetu zdravstvenih studija.

Osim nastavne djelatnosti, na Zavodu se od 1967. godine obavljaju stručne mikrobiološke usluge za potrebe zdravstvenih ustanova. Od 1960. godine nastavnici i suradnici Zavoda sudjeluju u znanstveno-istraživačkim projektima. Uz znanstveno-nastavno i stručno osoblje Zavoda pri izvođenju nastavnih i istraživačkih zadataka angažiraju se i studenti kako bi dodatno razvili svoje akademske i stručne kompetencije i vještine.

Od početka rada naša je misija usmjerena na osiguranje izvrsnosti u obrazovanju, istraživanju u području patogeneze bakterijskih infekcija i podizanju stručnih standarda u mikrobiologiji. Ciljevi daljnjeg razvitka nastavne i znanstvene djelatnosti Zavoda su kontinuirano unaprjeđivanje kvalitete nastave prema uputama iz Bolonjske deklaracije i Europske zajednice, napredovanje u znanstveno-nastavnim zvanjima nastavnika i suradnika, međunarodna znanstvena suradnja. Kontinuirano se provodi evaluacija nastave i poboljšavaju izvedbeni nastavni programi predmeta pri čemu se vodi računa o optimalnoj usklađenosti sa znanstveno-stručnim aktivnostima.

• Predstojnik
  • Prof. dr. sc. Maja Abram, dr. med.
    e-mail: maja.abram@medri.uniri.hr

• Nastavno osoblje
  • Prof. dr. sc. Maja Abram, dr. med.
    e-mail: maja.abram@medri.uniri.hr 
  • Prof. dr. sc. Darinka Vučković, dr. med.  
    e-mail: darinka.vuckovic@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Marina Šantić, dipl. sanit. ing. 
    e-mail: marina.santic@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Brigita Tićac, dr. med.  
    e-mail: brigita.ticac@medri.uniri.hr 
  • Prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje, dr. med. 
    e-mail: marina.bubonja@medri.uniri.hr  
  • Prof. dr. sc. Ivana Gobin, dipl. sanit. ing. 
    e-mail: ivana.gobin@uniri.hr  
  • Doc. dr. sc. Bojana Mohar Vitezić, mag. mikrobiol. 
    e-mail: bojana.mohar@medri.uniri.hr 
  • Doc. dr. sc. Mirna Mihelčić, dr. vet. med.  
    e-mail: mirna.mihelcic@medri.uniri.hr  
  • Dr. sc. Valentina Marečić, mag. sanit. ing. 
    e-mail: valentina.marecic@medri.uniri.hr  
  • Dr. sc. Dolores Peruč, dr. med. 
    e-mail: dolores.peruc@uniri.hr  
  • Davorka Repac Antić, dr. med. 
    e-mail: davorkaar@medri.uniri.hr

• Suradnici
  • Ina Viduka, mag. sanit. ing., asistentica na projektu,
    e-mail: ina.kelava@uniri.hr
  • Maša Knežević, mag. pharm. inv., asistentica na projektu,
    e-mail: masa.knezevic@medri.uniri.hr

• Nenastavno osoblje
  • Sandra Abramović, administrativna tajnica;
    e-mail: sandra.abramovic@medri.uniri.hr
  • Gabrijela Begić, mag. med. lab. diagn.,viša laborantica;
    e-mail: gabrijela.begic@uniri.hr
  • Danica Rebić, bacc. med. lab. diagn., viša laborantica;
    e-mail: danica.rebic@medri.uniri.hr
  • Gabriel Tomas, laborant; e-mail: gabriel.tomas@medri.uniri.hr
  • Mirjana Oljica, pomoćna teh. suradnica;
    e-mail: mirjana.oljica@medri.uniri.hr

Integrirani preddiplomski i diplomski sveučilišni studiji

Medicina

• Medicinska mikrobiologija i parazitologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Klinička mikrobiologija (integrirano s kolegijem Zarazne bolesti) (obvezni)
• Živjeti pod mikroskopom (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Antibiotici – žrtve vlastitog uspjeha (izbornij), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Patogeneza zaraznih bolesti (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje
• Tuberkuloza – prošlost i sadašnjost (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Britiga Tićac
• Primjenjena mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr.sc. Marina Šantić
• Mehanizam djelovanja probiotičkih mikroorganizama (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin

Medicina na engleskom jeziku

• Medical Microbiology and Parasitology (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Applied Microbiology (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić

Sanitarno inženjerstvo

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Mikrobiologija hrane (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Mikrobiologija voda (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Život pod mikroskopom (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Metode mikroskopije u mikrobiologiji (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić 
• Probiotički mikroorganizmi (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin
• Mikrobne zajednice u okolini (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin

Medicinsko laboratorijska dijagnostika

• Opća bakteriologija (obvezni), voditeljica: izv. prof. dr. sc.  Marina Bubonja Šonje 
• Medicinska bakteriologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Brigita Tićac 
• Medicinska virologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Brigita Tićac 
• Medicinska parazitologija i mikologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković 
• Klinička mikrobiologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram 
• Mikroskopija i mikroskopske tehnike (izborni), voditeljica: doc. dr. sc. Mateja Ožanič 
• Sterilizacija i dezinfekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc Marina Šantić 
• Stanične kulture (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić 
• Neobični mikrobi u različitim ekosustavima (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin 

Farmacija

• Medicinska mikrobiologija za farmaceute (obvezni), voditeljica: doc. dr. sc. Mateja Ožanič 
• Antibiotici žrtve vlastitog uspjeha (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram 

Poslijediplomski doktorski studiji

DOKTORSKA ŠKOLA IZ ZNANSTVENOG PODRUČJA BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO

• studijski program „Biomedicina“
  • Patogeneza bakterijskih infekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
  • Visokopatogeni mikroorganizmi (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić i prof. dr. sc. Alemka Markotić
  • Funkcionalna svojstva bakterija (metoda br. 18), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin, u sklopu obveznog kolegija “Primjena istraživačkih metoda u znanstvenom radu
  • Mikroskopija i mikroskopske tehnike (metoda br. 15), voditeljica: doc. dr. sc. Mateja Ožanič, u sklopu obveznog kolegija “Primjena istraživačkih metoda u znanstvenom radu

• studijski program „Zdravstveno i ekološko inženjerstvo”
  • Mikrobna rezistencija u okolišu (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin
  • Prijeteće zoonoze (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić

Poslijediplomski specijalistički studiji

Anesteziologija, reanimatologija i intenzivna medicina

• Klinička mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Hitna medicina

• Klinička mikrobiologija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Osim nastave za studente sveučilišnih dodiplomskih, diplomskih i poslijediplomskih studija Medicinskog fakulteta u Rijeci nastavnici i suradnici Zavoda uključeni su u nastavu kolegija koji se odvijaju na Fakultetu dentalne medicine te Fakultetu zdravstvenih studija Sveučilišta u Rijeci.
Voditelji su sljedećih kolegija:

pri Fakultetu dentalne medicine

Integrirani preddiplomski i diplomski sveučilišni studij Dentalna medicina

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram
• Microbiology and Parasitology (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Preddiplomski sveučilišni studij Dentalna higijena

• Osnove oralne mikrobiologije (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

pri Fakultetu zdravstvenih studija

Preddiplomski stručni studij Sestrinstvo

• Mikrobiologija s parazitologijom (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Hospitalne infekcije (izborni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje
• Otpornost mikroorganizama na fizikalne i kemijske čimbenike – sterilizacija i dezinfekcija (izborni), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić

Preddiplomski stručni studij Primaljstvo

• Opća mikrobiologija (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković
• Specijalna mikrobiologija u primaljstvu (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Darinka Vučković

Diplomski sveučilišni studij Sestrinstvo – menađment u sestrinstvu

• Infekcije povezane sa zdravstvenom skrbi (obvezni), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram

Diplomski sveučilišni studij Primaljstvo

• Prevencija i nadzor infekcija povezan sa zdravstvenom skrbi (obvezni), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje

Aktivni projekti

• Francisella – molekularni mehanizmi prilagodbe na stanice amebama (uniri-biomed-18-128), voditeljica: prof. dr. sc. Marina Šantić, potpora Sveučilišta u Rijeci
• Bakterijska patogeneza – od istraživanja do kliničke primjene (uniri-biomed-18-277), voditeljica: prof. dr. sc. Maja Abram, potpora Sveučilišta u Rijeci
• Oportunistički patogeni vodoopskrbnog sustava: novi izazov u obradi voda (uniri-biomed-18-171), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Ivana Gobin, potpora Sveučilišta u Rijeci
• Proširenost i klinički značaj HBs antigenih mutanti virusa hepatitisa B (uniri-biomed-18-215), voditeljica: izv. prof. dr. sc. Marina Bubonja Šonje, potpora Sveučilišta u Rijeci
• Uloga lamA gena u dugotrajnom preživljavanju Legionella pneumophila unutar Acanthamoeba castellanii (uniri-biomed-mladi-20-23), voditeljica: dr. sc. Valentina Marečić, potpora Sveučilišta u Rijeci
• Francycle (HRZZ-IP-06-2016-9003) voditeljica: prof. dr sc. Marina Šantić , Hrvatska zaklada za znanost
• Projekt razvoja karijere mladih istraživača-izobrazba novih doktora znanosti (DOK-01-2018), voditeljica/mentorica: prof. dr. sc. Marina Šantić, Hrvatska zaklada za znanost
• Projekt razvoja karijere mladih istraživača-izobrazba novih doktora znanosti (DOK-09-2018), voditeljica/mentorica: prof. dr. sc. Marina Šantić, Hrvatska zaklada za znanost
• Tulamibe (CNRS2017-5), Istraživački projekt francuske Agencije za znanost (CNRS), voditelj radnog paketa: prof. dr. sc. Marina Šantić.

Završeni projekti u posljednih 10 godina

• Projekt br. 13.06.1.1.07: Molekularni mehanizmi bakterijske patogeneze i odgovora na stres –potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: prof. dr. sc. Maja Abram
• Projekt br. 13.06.1.1.12: Francisella tularensis – unutarstanični život i patogeneza tularemije u miša –potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: prof. dr. sc. Marina Šantić
• Projekt br. 13.06.2.2.60: Mehanizmi patogeneze eksperimentalne legioneloze –potpora Sveučilišta u Rijeci, nositeljica potpore: doc. dr. sc. Ivana Gobin
• Patogeneza eksperimentalne legioneloze(062-0621273-1275) – gl. istraživač: prof. dr. sc. Miljenko Dorić, u okviru programa „Stanični i molekularni mehanizmi u odnosima između domaćina i prokariota” br. 062-0621273 (voditelj: prof. dr. sc. Miljenko Dorić) financiranog od MZOS RH
• Eksperimentalna perinatalna listerioza(062-0621273-1235) – gl. istraživačica: prof. dr. sc. Maja Abram, u okviru programa „Stanični i molekularni mehanizmi u odnosima između domaćina i prokariota” br. 062-0621273 (voditelj: prof. dr. sc. Miljenko Dorić) financiranog od MZOS RH
• Francisella tularensis – unutarstanični život i patogeneza tularemije u miša (062-0621273-0950) – gl. istraživačica: prof. dr. sc. Marina Šantić, u okviru programa „Stanični i molekularni mehanizmi u odnosima između domaćina i prokariota” br. 062-0621273 (voditelj: prof. dr. sc. Miljenko Dorić) financiranog od MZOS RH
• Ekološki aspekti legioneloza(062-0621273-0952) – gl. istraživačica: prof. dr. sc. Brigita Tićac, u okviru programa „Stanični i molekularni mehanizmi u odnosima između domaćina i prokariota” br. 062-0621273 (voditelj: prof. dr. sc. Miljenko Dorić) financiranog od MZOS RH
• Patogeneza eksperimentalne kampilobakterioze(062-0621273-0949) – gl. istraživačica: prof. dr. sc. Darinka Vučković, u okviru programa „Stanični i molekularni mehanizmi u odnosima između domaćina i prokariota” br. 062-0621273 (voditelj: prof. dr. sc. Miljenko Dorić) financiranog od MZOS RH
• WP4 Strenghtening research capacities of clinical microbiology (FP7-REGPOT-2010-5) – voditeljica radnog paketa: prof. dr. sc. Maja Abram, U okviru projekta “Upgrading the capacities for Research in Translational Medicine at the Faculty of Medicine University of Rijeka (TransMedRi)” br. 256686
• Ekološki aspekti legioneloza, voditeljica projekta: prof. dr. sc. Brigita Tićac, znanstveni projekt u sklopu plana upravljanja vodama u 2012. godini sufinanciran od Hrvatskih voda

10 najvažnijih publikacija u proteklih 5 godina

• M. Mušković, I. Ćavar, A. Lesar, M. Lončarić, N. Malatesti, I. Gobin: Photodynamic Inactivation of Legionella pneumophila Biofilm Formation by Cationic Tetra- and Tripyridylporphyrins in Waters of Different Hardness. International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22, 9095, doi:10.3390/ijms22169095
• A. Pavlić, G. Begić, M. Tota, M. Abram, S. Spalj, I. Gobin: Bacterial Exposure to Nickel: Influence on Adhesion and Biofilm Formation on Orthodontic Archwires and Sensitivity to Antimicrobial Agents. Materials, 2021, 14, 4603, doi.org/10.3390/ma14164603
• M. Matovina, M. Abram, D. Repac-Antić, S. Knežević, M Bubonja-Šonje: An outbreak of ertapenem-resistant, carbapenemase-negative and porin-deficient ESBL-producing Klebsiella pneumonia complex. GERMS, 11(2):199-210, June, 2021
• M. Ozanic, V. Marecic, M. Knezevic, A. Majstorovic, P. Zurga, M. Curlin, V. Piskur, D. Lenac, A. Bulog, M. Santic: The Important Role of Metal Ions for Suvrival of Francisella in Water within Amoeba Environment. BioMed Research International, vol. 2021, art. ID 6673642, doi.org/10.1155/2021/6673642
• T. Madarevic, A. Buterin, J. Jelicic, L. Sirola, D. Vuckovic: Functional recovery after two-stage short-interval revision of chronic periprothetic knee joint infection. International Orthopaedics, 2020, doi.org/101007/s00264-020-04566-1
• M. Knežević, V. Marečić, M. Ožanič, N. Špoljarić, I. Kelava, M. Ćurlin, Y. Abu Kwaik, M. Mihelčić, M. Šantić: Increased Sensitivity of Amoeba-Grown Francisella Species to Disinfectants. Microorganisms, 2020, 8, 1260, doi: 10.3390/microorganisms8091260
• C. Price, S. Jones, M. Mihelcic, M. Santic, Y. Abu Kwaik: Paradoxical Pro-inflammatory Responses by Human Macrophages to an Amoebae Host-Adapted Legionella Effector. Cell Host & Microbe, 27:571-584, April 8, 2020, doi:10.1016/j.chom.2020.03.003
• D. Peruč, B. Tićac, D. Broznić, Ž. Maglica, M. Šarolić, I. Gobin: Juniperus communis essential oil limit the biofilm formation of Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare on polystyrene in a temperature-dependent manner. International Journal of Environmental Health Research. 20 Mar 2020, doi: 10.1080/09603123.2020.1741519
• A. Klančnik, I. Gobin, B. Jeršek, s. Smole Možina, D. Vučković, M. Tušek Žnidarič, M. Abram: Adhesion of Campylobacter jejuni Is Increased in Association with Foodborne Bacteria. Microorganisms 2020, 8, 201; doi:10.3390/microorganisms8020201
• V. Marecic, O. Shevchuk, M. Ozanic, M. Mihelcic, M. Steinert, A. Jurak Begonja, Y. Abu Kwaik, M. Santic: Isolation of F. novicida-Containing Phagosome from Infected Human Monocyte Derived Macrophages. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, July 2017, vol. 7, article 303

• Ivana Gobin – Nagrada za nastavnu izvrsnost Sveučiliša u Rijeci u akad. god. 2020./21.
• Valentina Marečić – Nagrada za nastavnu izvrsnost Sveučilišta u Rijeci u akad. god. 2020./21.
• Mateja Ožanič – Nagrade Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici u 2016.
• Mateja Ožanič – Godišnja nagrada Hrvatskog mikrobiološkog društva za mlade znanstvenike za 2016. godinu
• Marina Šantić -Nagrada Primorsko-goranske županije za znanstvena dostignuća u 2010 godini
• Marina Šantić -Nagrada Grada Rijeke za znanstvena dostignuća iz područja biomedicine za godinu 2009.
• Marina Bubonja Šonje – Nagrada Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici za 2006./07.
• Marina Šantić – Državna nagrada za znanost iz područja biomedicinskih zananosti za godinu 2007.
• Marina Šantić – Nagrade Zaklade Sveučilišta u Rijeci za prirodne i biomedicinske znanosti u kategoriji asistent znanstveni novaci/asistenti/mladi znanstvenici za 2005./06.
• Marina Šantić – Priznanje Medicinskog fakulteta, Sveučilišta u Rijeci, kao najboljem mladom znanstveniku za temeljne medicinske znanosti i ostala znanstvena područja u 2005. godini.

Na Zavodu za mikrobiologiju provodi se mikrobiološka dijagnostika periprotetičkih infekcija postupkom sonikacije izvađenih implantata u ultrazvučnoj kupelji. Ultrazvuk pomaže odvajanju adheriranih mikroorganizama sa površine implantata (iz biofilma), u tekućinu koja se onda kultivira. Time se povećava mogućnost izolacije uzročnika infekcije.

Na Zavodu se također pripremaju humani fekalni uzorci koji se zatim dugotrajno pohranjuju u Biobanci koja se nalazi na Medicinskom fakultetu.