Genetička i epigenetička povezanost u multiploj sklerozi: uloga polimorfizama, metilacijskog statusa i regulacije mikroRNA u neurodegeneraciji
Izvor financiranja:
Broj projekta: uniri-iz-25-181
Voditelj projekta: Prof. dr. sc. Nada Starčević Čizmarević dipl.ing.
Suradnici:
- izv.prof.dr.sc. Jadranka Vraneković prof.biol.i kem.
- doc.prim.dr.sc Vladimira Vuletić dr.med
- Gloria Rožmarić
- Fabio Coppede
- Dolores Janko-Labinac
- Maja Živković
- Ivan Jovanović
- doktorandi:
- Ivana Stanković Matić
- Jasna Nekić, dr.med., spec.nuklearne medicine
Ukupno financiranje: 40.043,00 €
Kratki opis projekta:
Multipla skleroza (MS) je kompleksna autoimuna i neurodegenerativna bolest središnjeg živčanog sustava obilježena demijelinizacijom, kroničnom upalom i progresivnom degeneracijom aksona. Iako je genetska predispozicija potvrđena, poznati genetski čimbenici objašnjavaju samo dio etiologije bolesti, što naglašava važnost epigenetičkih i okolišnih čimbenika. Ovo istraživanje ima za cilj integraciju genetičkih i epigenetičkih analiza radi boljeg razumijevanja patofizioloških mehanizama MS-a kroz analizu genskih polimorfizma, metilacijskog statusa promotorskih regija i regulacije miRNA.
Istraživanje polimorfizama gena obuhvatilo bi 300 MS bolesnika i kontrolnih ispitanika usklađenih po dobi i spolu. Metilacijska i analiza miRNA planirane su u skupini od 50 do 90 MS bolesnika ovisno o kliničkom fenotipu i terapiji te u usklađenoj kontroli. Molekularno-genetičke metode uključuju PCR-RFLP i real-time PCR za analizu polimorfizama, bisulfitnu konverziju i MS–High Resolution Melting za gen specifičnu metilacijksu analizu te miRNA-seq za ekspresijsku analizu.
Geni povezani s metilacijom, neurodegeneracijom i autoimunim odgovorom, MTHFR, MTR, MTRR, DNMT1, DNMT3A, DNMT3B BDNF, MBP, MOG, FOXP3, NF-kB, IL-2RA, JAK i STAT, identificirani su kao relevantni putem GWAS studija i omics analize podataka. Uz gene uključene u autoimunost i mijelinizaciju, enzimi gena uključeni u metilaciju mogu biti od značaja za promjene u obrascima metilacije DNA i doprinijeti razvoju MS-a. Također ćemo istražiti miRNA koje reguliraju navedene gene kao i gene koje ćemo odabrati primjenom naprednih bioinformatičkih alata. Korelacija genetičkih i epigenetičkih podataka s kliničkim fenotipovima omogućit će identifikaciju biomarkera potencijalno korisnih za buduće dijagnostičke i terapijske protokole te doprinijeti razumijevanju interakcije gena i epigenoma u MS-u. Očekuje se značajan znanstveni, klinički i društveni doprinos, uz mogućnost međunarodne suradnje i kliničke primjene rezultata.
Fotografije (vizualni sažetak ili ostale fotografije koje ilustriraju istraživanje):
Publikacije:
Pozvana predavanja:
Usavršavanja:
Odobreni projekti za financiranje:
Poveznice na ostale stranice projekta:
CroRIS