Varijabilnost genoma prijevremeno rođene djece: od sekvenciranja do funkcionalnih studija
Izvor financiranja:
Broj projekta: uniri-iz-25-24
Voditelj projekta: izv. prof. dr. sc. Sanja Dević Pavlić dipl. sanit. ing.
Suradnici:
- doc. dr. sc. Lara Saftić Martinović mag.pharm.inv.
- izv. prof. dr. sc. Nina Pereza dr. med.
- dr. sc. Anita Barišić, dr. med.
- Emilia Fornal
- Aleš Maver
Ukupno financiranje: 47.979,25 €
Kratki opis projekta:
Prijevremeni porod jedan je od vodećih uzroka neonatalne smrtnosti i dugoročnih zdravstvenih komplikacija, a njegova etiologija uključuje složene genetičke, epigenetičke i metaboličke čimbenike. Iako su prethodna istraživanja identificirala genetičke varijante u genomu majki prijevremeno rođene djece, povezane s idiopatskim spontanim prijevremenim porodom (ISPP), funkcionalni mehanizmi koji povezuju ove promjene s metaboličkim i transkriptomskim profilima još uvijek nisu dovoljno istraženi. Istovremeno, sve veći broj dokaza upućuje na značajnu ulogu genetičkih čimbenika u genomima prijevremeno rođene djece za koje se pretpostavlja da varijaciji rizika za ISPP doprinose do čak 30%.
U skladu s time, cilj ovog istraživanja je identificirati genetičke varijante povezane s ISPP-om u prijevremeno rođene djece i procijeniti njihov potencijalni funkcionalni učinak. Navedeno će se provesti kroz četiri faze istraživanja. Prva faza uključuje sustavni pregled literature i metaanalizu kako bi se identificirali geni kandidati povezani s ISPP-om, čime će se formirati sveobuhvatan panel gena relevantnih za patogenezu bolesti. Druga faza obuhvatit će sekvenciranje cjelokupnog egzoma (WES) u prijevremeno rođene djece, pri čemu će se analizirati prisutnost genetičkih varijanti u cijelom egzomu i u panelu gena kandidata, uz naknadnu analizu opterećenja. Treća faza fokusirat će se na epigenetičke analize, odnosno ispitivanje funkcionalnog učinka identificiranih varijanti analizom metilacije promotora gena. Četvrta faza uključuje ciljano i neciljano metabolomsko profiliranje metodom LC-MS/MS, s ciljem istraživanja metaboličkih promjena povezanih s ISPP-om.
Očekuje se da će rezultati ovog istraživanja unaprijediti razumijevanje patofizioloških mehanizama ISPP-a te omogućiti razvoj preciznijih strategija za njegovu prevenciju i dijagnostiku, temeljenih na kombinaciji genetičkih, epigenetičkih i metaboličkih čimbenika.
Fotografije (vizualni sažetak ili ostale fotografije koje ilustriraju istraživanje):
Publikacije:
Pozvana predavanja:
Usavršavanja:
Odobreni projekti za financiranje:
- Uloga varijabilnosti genoma žene u idiopatskom spontanom prijevremenom porodu (uniri-iskusni-biomed-23-195)
Poveznice na ostale stranice projekta:
CroRIS